Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Z2

PKN3, Serine/threonine-protein kinase N3, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3Q6P5Z2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKN3Q6P5Z2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKN3Q6P5Z2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKN3Q6P5Z2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKN3Q6P5Z2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKN3Q6P5Z2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKN3Q6P5Z2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKN3Q6P5Z2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKN3Q6P5Z2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKN3Q6P5Z2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKN3Q6P5Z2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKN3Q6P5Z2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PKN3Q6P5Z2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKN3Q6P5Z2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PKN3Q6P5Z2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKN3Q6P5Z2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKN3Q6P5Z2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKN3Q6P5Z2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKN3Q6P5Z2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PKN3Q6P5Z2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKN3Q6P5Z2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKN3Q6P5Z2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKN3Q6P5Z2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKN3Q6P5Z2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKN3Q6P5Z2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKN3Q6P5Z2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKN3Q6P5Z2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKN3Q6P5Z2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKN3Q6P5Z2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKN3Q6P5Z2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKN3Q6P5Z2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKN3Q6P5Z2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKN3Q6P5Z2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKN3Q6P5Z2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKN3Q6P5Z2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKN3Q6P5Z2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKN3Q6P5Z2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKN3Q6P5Z2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PKN3Q6P5Z2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKN3Q6P5Z2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKN3Q6P5Z2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKN3Q6P5Z2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKN3Q6P5Z2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKN3Q6P5Z2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKN3Q6P5Z2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKN3Q6P5Z2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKN3Q6P5Z2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKN3Q6P5Z2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKN3Q6P5Z2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKN3Q6P5Z2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKN3Q6P5Z2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKN3Q6P5Z2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PKN3Q6P5Z2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PKN3Q6P5Z2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKN3Q6P5Z2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKN3Q6P5Z2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKN3Q6P5Z2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms