Protein–RNA interactions for Protein: Q5TG30

ARHGAP40, Rho GTPase-activating protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP40Q5TG30 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARHGAP40Q5TG30 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARHGAP40Q5TG30 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARHGAP40Q5TG30 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARHGAP40Q5TG30 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARHGAP40Q5TG30 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARHGAP40Q5TG30 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARHGAP40Q5TG30 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARHGAP40Q5TG30 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARHGAP40Q5TG30 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARHGAP40Q5TG30 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARHGAP40Q5TG30 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARHGAP40Q5TG30 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARHGAP40Q5TG30 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARHGAP40Q5TG30 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARHGAP40Q5TG30 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARHGAP40Q5TG30 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARHGAP40Q5TG30 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARHGAP40Q5TG30 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARHGAP40Q5TG30 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARHGAP40Q5TG30 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGAP40Q5TG30 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP40Q5TG30 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms