Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
CEP170Q5SW79 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC39.34■■■■□ 3.89
CEP170Q5SW79 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
CEP170Q5SW79 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
CEP170Q5SW79 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
CEP170Q5SW79 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
CEP170Q5SW79 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
CEP170Q5SW79 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
CEP170Q5SW79 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
CEP170Q5SW79 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
CEP170Q5SW79 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
CEP170Q5SW79 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
CEP170Q5SW79 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
CEP170Q5SW79 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
CEP170Q5SW79 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CEP170Q5SW79 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
CEP170Q5SW79 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CEP170Q5SW79 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
CEP170Q5SW79 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CEP170Q5SW79 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
CEP170Q5SW79 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
CEP170Q5SW79 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
CEP170Q5SW79 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
CEP170Q5SW79 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
CEP170Q5SW79 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
CEP170Q5SW79 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
CEP170Q5SW79 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
CEP170Q5SW79 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC39.28■■■■□ 3.88
CEP170Q5SW79 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
CEP170Q5SW79 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
CEP170Q5SW79 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
CEP170Q5SW79 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
CEP170Q5SW79 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
CEP170Q5SW79 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC39.25■■■■□ 3.87
CEP170Q5SW79 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC39.25■■■■□ 3.87
CEP170Q5SW79 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
CEP170Q5SW79 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
CEP170Q5SW79 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
CEP170Q5SW79 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
CEP170Q5SW79 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
CEP170Q5SW79 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC39.23■■■■□ 3.87
CEP170Q5SW79 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CEP170Q5SW79 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CEP170Q5SW79 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
CEP170Q5SW79 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CEP170Q5SW79 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
CEP170Q5SW79 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
CEP170Q5SW79 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
CEP170Q5SW79 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.19■■■■□ 3.86
CEP170Q5SW79 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
CEP170Q5SW79 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC39.19■■■■□ 3.86
CEP170Q5SW79 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
CEP170Q5SW79 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
CEP170Q5SW79 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
CEP170Q5SW79 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
CEP170Q5SW79 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
CEP170Q5SW79 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
CEP170Q5SW79 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
CEP170Q5SW79 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
CEP170Q5SW79 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
CEP170Q5SW79 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
CEP170Q5SW79 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
CEP170Q5SW79 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CEP170Q5SW79 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CEP170Q5SW79 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CEP170Q5SW79 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
CEP170Q5SW79 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
CEP170Q5SW79 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
CEP170Q5SW79 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
CEP170Q5SW79 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
CEP170Q5SW79 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC39.15■■■■□ 3.86
CEP170Q5SW79 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
CEP170Q5SW79 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
CEP170Q5SW79 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
CEP170Q5SW79 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
CEP170Q5SW79 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
CEP170Q5SW79 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
CEP170Q5SW79 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
CEP170Q5SW79 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC39.13■■■■□ 3.85
CEP170Q5SW79 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC39.13■■■■□ 3.85
CEP170Q5SW79 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
CEP170Q5SW79 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
CEP170Q5SW79 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
CEP170Q5SW79 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
CEP170Q5SW79 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
CEP170Q5SW79 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
CEP170Q5SW79 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
CEP170Q5SW79 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
CEP170Q5SW79 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
CEP170Q5SW79 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
CEP170Q5SW79 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
CEP170Q5SW79 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC39.1■■■■□ 3.85
CEP170Q5SW79 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
CEP170Q5SW79 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
CEP170Q5SW79 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
CEP170Q5SW79 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC39.09■■■■□ 3.85
CEP170Q5SW79 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
CEP170Q5SW79 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC39.08■■■■□ 3.85
CEP170Q5SW79 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
CEP170Q5SW79 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms