Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTMR3Q13615 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MTMR3Q13615 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
MTMR3Q13615 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MTMR3Q13615 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTMR3Q13615 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MTMR3Q13615 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTMR3Q13615 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTMR3Q13615 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTMR3Q13615 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTMR3Q13615 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MTMR3Q13615 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTMR3Q13615 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTMR3Q13615 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MTMR3Q13615 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTMR3Q13615 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTMR3Q13615 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTMR3Q13615 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTMR3Q13615 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTMR3Q13615 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTMR3Q13615 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MTMR3Q13615 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTMR3Q13615 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTMR3Q13615 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MTMR3Q13615 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTMR3Q13615 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTMR3Q13615 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTMR3Q13615 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTMR3Q13615 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTMR3Q13615 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTMR3Q13615 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTMR3Q13615 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTMR3Q13615 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTMR3Q13615 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTMR3Q13615 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTMR3Q13615 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTMR3Q13615 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTMR3Q13615 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTMR3Q13615 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTMR3Q13615 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTMR3Q13615 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTMR3Q13615 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTMR3Q13615 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTMR3Q13615 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTMR3Q13615 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTMR3Q13615 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTMR3Q13615 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTMR3Q13615 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTMR3Q13615 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTMR3Q13615 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTMR3Q13615 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTMR3Q13615 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTMR3Q13615 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MTMR3Q13615 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTMR3Q13615 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTMR3Q13615 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTMR3Q13615 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTMR3Q13615 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTMR3Q13615 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTMR3Q13615 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTMR3Q13615 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTMR3Q13615 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTMR3Q13615 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTMR3Q13615 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTMR3Q13615 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTMR3Q13615 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTMR3Q13615 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms