Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RLFQ13129 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RLFQ13129 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RLFQ13129 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RLFQ13129 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RLFQ13129 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RLFQ13129 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RLFQ13129 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RLFQ13129 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RLFQ13129 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RLFQ13129 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RLFQ13129 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RLFQ13129 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RLFQ13129 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RLFQ13129 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RLFQ13129 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RLFQ13129 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RLFQ13129 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RLFQ13129 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RLFQ13129 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RLFQ13129 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RLFQ13129 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RLFQ13129 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RLFQ13129 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RLFQ13129 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RLFQ13129 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RLFQ13129 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RLFQ13129 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RLFQ13129 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RLFQ13129 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RLFQ13129 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RLFQ13129 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RLFQ13129 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RLFQ13129 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RLFQ13129 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RLFQ13129 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RLFQ13129 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RLFQ13129 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RLFQ13129 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RLFQ13129 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RLFQ13129 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RLFQ13129 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RLFQ13129 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RLFQ13129 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RLFQ13129 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RLFQ13129 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RLFQ13129 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RLFQ13129 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RLFQ13129 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RLFQ13129 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RLFQ13129 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RLFQ13129 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RLFQ13129 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RLFQ13129 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RLFQ13129 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RLFQ13129 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RLFQ13129 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RLFQ13129 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RLFQ13129 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RLFQ13129 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RLFQ13129 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RLFQ13129 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RLFQ13129 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RLFQ13129 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RLFQ13129 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RLFQ13129 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RLFQ13129 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RLFQ13129 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RLFQ13129 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RLFQ13129 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RLFQ13129 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RLFQ13129 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RLFQ13129 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RLFQ13129 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RLFQ13129 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RLFQ13129 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RLFQ13129 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RLFQ13129 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RLFQ13129 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RLFQ13129 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RLFQ13129 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RLFQ13129 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RLFQ13129 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RLFQ13129 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RLFQ13129 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RLFQ13129 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RLFQ13129 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RLFQ13129 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RLFQ13129 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RLFQ13129 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RLFQ13129 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RLFQ13129 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RLFQ13129 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RLFQ13129 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RLFQ13129 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RLFQ13129 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RLFQ13129 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RLFQ13129 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RLFQ13129 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RLFQ13129 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
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