Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
IRX6P78412 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
IRX6P78412 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
IRX6P78412 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
IRX6P78412 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
IRX6P78412 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
IRX6P78412 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
IRX6P78412 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
IRX6P78412 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
IRX6P78412 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
IRX6P78412 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
IRX6P78412 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
IRX6P78412 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
IRX6P78412 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
IRX6P78412 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
IRX6P78412 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
IRX6P78412 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
IRX6P78412 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
IRX6P78412 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
IRX6P78412 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
IRX6P78412 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
IRX6P78412 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
IRX6P78412 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
IRX6P78412 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
IRX6P78412 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
IRX6P78412 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
IRX6P78412 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
IRX6P78412 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
IRX6P78412 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
IRX6P78412 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
IRX6P78412 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
IRX6P78412 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
IRX6P78412 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
IRX6P78412 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
IRX6P78412 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
IRX6P78412 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
IRX6P78412 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
IRX6P78412 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
IRX6P78412 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
IRX6P78412 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
IRX6P78412 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
IRX6P78412 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
IRX6P78412 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
IRX6P78412 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
IRX6P78412 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
IRX6P78412 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
IRX6P78412 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
IRX6P78412 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
IRX6P78412 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
IRX6P78412 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
IRX6P78412 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
IRX6P78412 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
IRX6P78412 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
IRX6P78412 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
IRX6P78412 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
IRX6P78412 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
IRX6P78412 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
IRX6P78412 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
IRX6P78412 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
IRX6P78412 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
IRX6P78412 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
IRX6P78412 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
IRX6P78412 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
IRX6P78412 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
IRX6P78412 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
IRX6P78412 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
IRX6P78412 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
IRX6P78412 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
IRX6P78412 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
IRX6P78412 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
IRX6P78412 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
IRX6P78412 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
IRX6P78412 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
IRX6P78412 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
IRX6P78412 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
IRX6P78412 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
IRX6P78412 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
IRX6P78412 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
IRX6P78412 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
IRX6P78412 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
IRX6P78412 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
IRX6P78412 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
IRX6P78412 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
IRX6P78412 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
IRX6P78412 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
IRX6P78412 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
IRX6P78412 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
IRX6P78412 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
IRX6P78412 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
IRX6P78412 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
IRX6P78412 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
IRX6P78412 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
IRX6P78412 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
IRX6P78412 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
IRX6P78412 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
IRX6P78412 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
IRX6P78412 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
IRX6P78412 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
IRX6P78412 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
IRX6P78412 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms