Protein–RNA interactions for Protein: P48723

HSPA13, Heat shock 70 kDa protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA13P48723 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HSPA13P48723 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSPA13P48723 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSPA13P48723 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSPA13P48723 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSPA13P48723 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSPA13P48723 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSPA13P48723 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSPA13P48723 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSPA13P48723 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPA13P48723 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPA13P48723 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPA13P48723 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPA13P48723 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPA13P48723 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPA13P48723 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPA13P48723 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPA13P48723 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPA13P48723 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPA13P48723 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPA13P48723 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPA13P48723 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPA13P48723 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPA13P48723 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPA13P48723 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPA13P48723 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPA13P48723 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPA13P48723 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPA13P48723 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPA13P48723 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPA13P48723 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPA13P48723 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPA13P48723 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPA13P48723 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPA13P48723 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPA13P48723 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPA13P48723 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPA13P48723 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPA13P48723 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HSPA13P48723 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HSPA13P48723 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSPA13P48723 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms