Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RXRGP48443 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RXRGP48443 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RXRGP48443 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RXRGP48443 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RXRGP48443 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RXRGP48443 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RXRGP48443 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RXRGP48443 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RXRGP48443 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RXRGP48443 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RXRGP48443 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RXRGP48443 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RXRGP48443 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RXRGP48443 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RXRGP48443 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RXRGP48443 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RXRGP48443 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RXRGP48443 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RXRGP48443 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RXRGP48443 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RXRGP48443 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RXRGP48443 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RXRGP48443 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RXRGP48443 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RXRGP48443 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RXRGP48443 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RXRGP48443 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RXRGP48443 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RXRGP48443 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RXRGP48443 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RXRGP48443 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RXRGP48443 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RXRGP48443 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RXRGP48443 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RXRGP48443 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RXRGP48443 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RXRGP48443 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RXRGP48443 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RXRGP48443 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RXRGP48443 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RXRGP48443 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RXRGP48443 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RXRGP48443 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RXRGP48443 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RXRGP48443 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RXRGP48443 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RXRGP48443 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RXRGP48443 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RXRGP48443 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RXRGP48443 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RXRGP48443 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RXRGP48443 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RXRGP48443 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RXRGP48443 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RXRGP48443 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RXRGP48443 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RXRGP48443 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RXRGP48443 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RXRGP48443 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RXRGP48443 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RXRGP48443 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RXRGP48443 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RXRGP48443 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RXRGP48443 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RXRGP48443 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RXRGP48443 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RXRGP48443 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RXRGP48443 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RXRGP48443 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RXRGP48443 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RXRGP48443 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RXRGP48443 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RXRGP48443 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RXRGP48443 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RXRGP48443 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RXRGP48443 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RXRGP48443 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RXRGP48443 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RXRGP48443 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RXRGP48443 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RXRGP48443 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RXRGP48443 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RXRGP48443 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RXRGP48443 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RXRGP48443 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RXRGP48443 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RXRGP48443 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RXRGP48443 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RXRGP48443 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RXRGP48443 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RXRGP48443 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RXRGP48443 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RXRGP48443 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RXRGP48443 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RXRGP48443 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RXRGP48443 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RXRGP48443 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RXRGP48443 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RXRGP48443 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms