Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RXRGP48443 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RXRGP48443 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RXRGP48443 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
RXRGP48443 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RXRGP48443 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RXRGP48443 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
RXRGP48443 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
RXRGP48443 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RXRGP48443 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
RXRGP48443 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
RXRGP48443 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
RXRGP48443 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
RXRGP48443 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
RXRGP48443 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
RXRGP48443 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
RXRGP48443 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
RXRGP48443 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
RXRGP48443 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
RXRGP48443 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
RXRGP48443 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RXRGP48443 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RXRGP48443 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
RXRGP48443 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RXRGP48443 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RXRGP48443 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RXRGP48443 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RXRGP48443 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RXRGP48443 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
RXRGP48443 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RXRGP48443 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RXRGP48443 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RXRGP48443 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RXRGP48443 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RXRGP48443 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RXRGP48443 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RXRGP48443 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
RXRGP48443 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
RXRGP48443 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
RXRGP48443 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RXRGP48443 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RXRGP48443 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RXRGP48443 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RXRGP48443 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RXRGP48443 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RXRGP48443 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RXRGP48443 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RXRGP48443 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RXRGP48443 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RXRGP48443 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RXRGP48443 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RXRGP48443 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RXRGP48443 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RXRGP48443 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
RXRGP48443 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RXRGP48443 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
RXRGP48443 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RXRGP48443 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RXRGP48443 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RXRGP48443 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RXRGP48443 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RXRGP48443 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RXRGP48443 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RXRGP48443 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RXRGP48443 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RXRGP48443 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RXRGP48443 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RXRGP48443 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RXRGP48443 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RXRGP48443 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RXRGP48443 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RXRGP48443 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RXRGP48443 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RXRGP48443 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RXRGP48443 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RXRGP48443 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RXRGP48443 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RXRGP48443 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RXRGP48443 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RXRGP48443 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RXRGP48443 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RXRGP48443 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RXRGP48443 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RXRGP48443 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RXRGP48443 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RXRGP48443 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RXRGP48443 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RXRGP48443 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RXRGP48443 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RXRGP48443 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RXRGP48443 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RXRGP48443 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RXRGP48443 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RXRGP48443 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RXRGP48443 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RXRGP48443 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RXRGP48443 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RXRGP48443 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RXRGP48443 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RXRGP48443 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms