Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GNPDA1P46926 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GNPDA1P46926 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GNPDA1P46926 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GNPDA1P46926 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GNPDA1P46926 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GNPDA1P46926 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GNPDA1P46926 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GNPDA1P46926 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GNPDA1P46926 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GNPDA1P46926 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GNPDA1P46926 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GNPDA1P46926 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GNPDA1P46926 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GNPDA1P46926 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GNPDA1P46926 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GNPDA1P46926 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GNPDA1P46926 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GNPDA1P46926 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GNPDA1P46926 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GNPDA1P46926 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GNPDA1P46926 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GNPDA1P46926 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GNPDA1P46926 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GNPDA1P46926 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GNPDA1P46926 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GNPDA1P46926 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GNPDA1P46926 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GNPDA1P46926 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GNPDA1P46926 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GNPDA1P46926 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GNPDA1P46926 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GNPDA1P46926 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GNPDA1P46926 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GNPDA1P46926 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GNPDA1P46926 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GNPDA1P46926 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GNPDA1P46926 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GNPDA1P46926 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GNPDA1P46926 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GNPDA1P46926 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GNPDA1P46926 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GNPDA1P46926 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GNPDA1P46926 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GNPDA1P46926 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GNPDA1P46926 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GNPDA1P46926 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GNPDA1P46926 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GNPDA1P46926 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GNPDA1P46926 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GNPDA1P46926 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GNPDA1P46926 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GNPDA1P46926 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GNPDA1P46926 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GNPDA1P46926 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GNPDA1P46926 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GNPDA1P46926 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GNPDA1P46926 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GNPDA1P46926 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GNPDA1P46926 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GNPDA1P46926 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GNPDA1P46926 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GNPDA1P46926 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GNPDA1P46926 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GNPDA1P46926 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GNPDA1P46926 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GNPDA1P46926 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GNPDA1P46926 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GNPDA1P46926 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GNPDA1P46926 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GNPDA1P46926 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GNPDA1P46926 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GNPDA1P46926 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GNPDA1P46926 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GNPDA1P46926 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GNPDA1P46926 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GNPDA1P46926 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GNPDA1P46926 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GNPDA1P46926 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GNPDA1P46926 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GNPDA1P46926 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GNPDA1P46926 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GNPDA1P46926 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GNPDA1P46926 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GNPDA1P46926 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GNPDA1P46926 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GNPDA1P46926 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GNPDA1P46926 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GNPDA1P46926 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GNPDA1P46926 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GNPDA1P46926 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GNPDA1P46926 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GNPDA1P46926 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GNPDA1P46926 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GNPDA1P46926 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNPDA1P46926 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNPDA1P46926 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNPDA1P46926 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNPDA1P46926 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNPDA1P46926 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms