Protein–RNA interactions for Protein: P28222

HTR1B, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1BP28222 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HTR1BP28222 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTR1BP28222 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTR1BP28222 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTR1BP28222 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTR1BP28222 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTR1BP28222 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTR1BP28222 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HTR1BP28222 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTR1BP28222 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTR1BP28222 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HTR1BP28222 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTR1BP28222 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTR1BP28222 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTR1BP28222 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTR1BP28222 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTR1BP28222 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HTR1BP28222 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTR1BP28222 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTR1BP28222 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTR1BP28222 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTR1BP28222 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTR1BP28222 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTR1BP28222 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTR1BP28222 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTR1BP28222 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTR1BP28222 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTR1BP28222 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTR1BP28222 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTR1BP28222 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTR1BP28222 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTR1BP28222 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTR1BP28222 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTR1BP28222 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTR1BP28222 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTR1BP28222 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTR1BP28222 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTR1BP28222 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTR1BP28222 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTR1BP28222 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTR1BP28222 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTR1BP28222 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTR1BP28222 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTR1BP28222 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTR1BP28222 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTR1BP28222 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTR1BP28222 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTR1BP28222 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTR1BP28222 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTR1BP28222 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTR1BP28222 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTR1BP28222 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTR1BP28222 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTR1BP28222 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTR1BP28222 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTR1BP28222 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTR1BP28222 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTR1BP28222 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTR1BP28222 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTR1BP28222 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTR1BP28222 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTR1BP28222 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTR1BP28222 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTR1BP28222 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms