Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTGS1P23219 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTGS1P23219 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTGS1P23219 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTGS1P23219 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTGS1P23219 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTGS1P23219 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PTGS1P23219 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTGS1P23219 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTGS1P23219 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTGS1P23219 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTGS1P23219 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTGS1P23219 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTGS1P23219 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTGS1P23219 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTGS1P23219 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTGS1P23219 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTGS1P23219 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTGS1P23219 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTGS1P23219 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTGS1P23219 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTGS1P23219 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTGS1P23219 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTGS1P23219 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTGS1P23219 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTGS1P23219 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PTGS1P23219 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTGS1P23219 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTGS1P23219 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTGS1P23219 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTGS1P23219 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PTGS1P23219 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTGS1P23219 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTGS1P23219 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTGS1P23219 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTGS1P23219 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTGS1P23219 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTGS1P23219 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTGS1P23219 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTGS1P23219 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTGS1P23219 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTGS1P23219 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTGS1P23219 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTGS1P23219 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTGS1P23219 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.58■■■□□ 2
PTGS1P23219 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
PTGS1P23219 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PTGS1P23219 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PTGS1P23219 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTGS1P23219 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PTGS1P23219 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTGS1P23219 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133 ms