Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYP2C9P11712 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYP2C9P11712 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYP2C9P11712 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYP2C9P11712 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYP2C9P11712 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYP2C9P11712 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYP2C9P11712 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYP2C9P11712 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYP2C9P11712 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYP2C9P11712 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYP2C9P11712 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CYP2C9P11712 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CYP2C9P11712 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CYP2C9P11712 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYP2C9P11712 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYP2C9P11712 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYP2C9P11712 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYP2C9P11712 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYP2C9P11712 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYP2C9P11712 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYP2C9P11712 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYP2C9P11712 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYP2C9P11712 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CYP2C9P11712 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CYP2C9P11712 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CYP2C9P11712 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CYP2C9P11712 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CYP2C9P11712 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CYP2C9P11712 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CYP2C9P11712 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CYP2C9P11712 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CYP2C9P11712 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CYP2C9P11712 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CYP2C9P11712 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CYP2C9P11712 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CYP2C9P11712 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CYP2C9P11712 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CYP2C9P11712 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CYP2C9P11712 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CYP2C9P11712 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CYP2C9P11712 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CYP2C9P11712 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CYP2C9P11712 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CYP2C9P11712 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CYP2C9P11712 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CYP2C9P11712 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CYP2C9P11712 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CYP2C9P11712 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYP2C9P11712 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYP2C9P11712 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYP2C9P11712 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYP2C9P11712 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYP2C9P11712 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYP2C9P11712 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CYP2C9P11712 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CYP2C9P11712 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CYP2C9P11712 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CYP2C9P11712 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CYP2C9P11712 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CYP2C9P11712 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CYP2C9P11712 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CYP2C9P11712 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYP2C9P11712 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYP2C9P11712 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYP2C9P11712 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYP2C9P11712 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYP2C9P11712 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYP2C9P11712 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYP2C9P11712 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CYP2C9P11712 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CYP2C9P11712 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CYP2C9P11712 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CYP2C9P11712 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CYP2C9P11712 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CYP2C9P11712 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CYP2C9P11712 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CYP2C9P11712 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CYP2C9P11712 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CYP2C9P11712 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CYP2C9P11712 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CYP2C9P11712 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CYP2C9P11712 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYP2C9P11712 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYP2C9P11712 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYP2C9P11712 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYP2C9P11712 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYP2C9P11712 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYP2C9P11712 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYP2C9P11712 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYP2C9P11712 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYP2C9P11712 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CYP2C9P11712 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CYP2C9P11712 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CYP2C9P11712 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CYP2C9P11712 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CYP2C9P11712 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CYP2C9P11712 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CYP2C9P11712 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CYP2C9P11712 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms