Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UPP2O95045 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
UPP2O95045 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
UPP2O95045 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UPP2O95045 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UPP2O95045 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UPP2O95045 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UPP2O95045 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UPP2O95045 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UPP2O95045 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UPP2O95045 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UPP2O95045 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UPP2O95045 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
UPP2O95045 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UPP2O95045 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UPP2O95045 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UPP2O95045 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UPP2O95045 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UPP2O95045 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UPP2O95045 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UPP2O95045 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
UPP2O95045 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
UPP2O95045 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UPP2O95045 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UPP2O95045 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UPP2O95045 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UPP2O95045 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UPP2O95045 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
UPP2O95045 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UPP2O95045 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UPP2O95045 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UPP2O95045 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UPP2O95045 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UPP2O95045 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
UPP2O95045 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPP2O95045 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPP2O95045 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPP2O95045 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPP2O95045 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPP2O95045 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPP2O95045 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPP2O95045 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPP2O95045 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPP2O95045 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPP2O95045 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPP2O95045 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UPP2O95045 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UPP2O95045 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UPP2O95045 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UPP2O95045 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UPP2O95045 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UPP2O95045 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UPP2O95045 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UPP2O95045 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UPP2O95045 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UPP2O95045 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UPP2O95045 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UPP2O95045 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UPP2O95045 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
UPP2O95045 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UPP2O95045 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UPP2O95045 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UPP2O95045 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UPP2O95045 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UPP2O95045 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UPP2O95045 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UPP2O95045 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UPP2O95045 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UPP2O95045 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UPP2O95045 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UPP2O95045 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UPP2O95045 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UPP2O95045 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UPP2O95045 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UPP2O95045 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UPP2O95045 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UPP2O95045 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UPP2O95045 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UPP2O95045 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UPP2O95045 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
UPP2O95045 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
UPP2O95045 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UPP2O95045 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UPP2O95045 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
UPP2O95045 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26■■□□□ 1.75
UPP2O95045 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UPP2O95045 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UPP2O95045 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UPP2O95045 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UPP2O95045 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UPP2O95045 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UPP2O95045 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UPP2O95045 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UPP2O95045 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UPP2O95045 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UPP2O95045 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UPP2O95045 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UPP2O95045 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UPP2O95045 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UPP2O95045 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms