Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 UBR5-208ENST00000520898 582 ntTSL 34.69□□□□□ -1.666e-11■■■■■ 28.4
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PRPF8Q6P2Q9 EDC3-210ENST00000566219 688 ntTSL 314.07□□□□□ -0.167e-7■■■■■ 28.4
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PRPF8Q6P2Q9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.197e-7■■■■■ 28.4
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PRPF8Q6P2Q9 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.467e-8■■■■■ 28.4
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PRPF8Q6P2Q9 GEMIN2-211ENST00000531684 630 ntTSL 56.45□□□□□ -1.383e-6■■■■■ 28.4
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