RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589851.1

PTPRS-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRS, Length 1,270 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-207ENST00000589851 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.48■■■■□ 3.75
PTPRS-207ENST00000589851 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.22■■■■□ 3.07
PTPRS-207ENST00000589851 ABCC9O60706 1549 aa33.44■■■□□ 2.94
PTPRS-207ENST00000589851 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.2■■■□□ 2.75
PTPRS-207ENST00000589851 NACADO15069 1562 aa32.18■■■□□ 2.74
PTPRS-207ENST00000589851 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.11■■■□□ 2.73
PTPRS-207ENST00000589851 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.04■■■□□ 2.72
PTPRS-207ENST00000589851 MYO15BQ96JP2 1530 aa32■■■□□ 2.71
PTPRS-207ENST00000589851 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.86■■■□□ 2.69
PTPRS-207ENST00000589851 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.49■■■□□ 2.63
PTPRS-207ENST00000589851 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.24■■■□□ 2.59
PTPRS-207ENST00000589851 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.23■■■□□ 2.59
PTPRS-207ENST00000589851 SCRIBQ14160 1630 aa31.18■■■□□ 2.58
PTPRS-207ENST00000589851 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.92■■■□□ 2.54
PTPRS-207ENST00000589851 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.71■■■□□ 2.51
PTPRS-207ENST00000589851 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
PTPRS-207ENST00000589851 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.27■■■□□ 2.44
PTPRS-207ENST00000589851 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.06■■■□□ 2.4
PTPRS-207ENST00000589851 SMARCA4P51532 1647 aa29.85■■■□□ 2.37
PTPRS-207ENST00000589851 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
PTPRS-207ENST00000589851 NCAPD3P42695 1498 aa29.69■■■□□ 2.34
PTPRS-207ENST00000589851 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.69■■■□□ 2.34
PTPRS-207ENST00000589851 SMARCA2P51531 1590 aa29.67■■■□□ 2.34
PTPRS-207ENST00000589851 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.64■■■□□ 2.34
PTPRS-207ENST00000589851 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.58■■■□□ 2.33
PTPRS-207ENST00000589851 HMGXB3Q12766 1538 aa29.54■■■□□ 2.32
PTPRS-207ENST00000589851 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
PTPRS-207ENST00000589851 WIZO95785 1651 aa29.33■■■□□ 2.29
PTPRS-207ENST00000589851 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
PTPRS-207ENST00000589851 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
PTPRS-207ENST00000589851 NESP48681 1621 aa28.94■■■□□ 2.22
PTPRS-207ENST00000589851 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.9■■■□□ 2.22
PTPRS-207ENST00000589851 ERCC6Q03468 1493 aa28.83■■■□□ 2.21
PTPRS-207ENST00000589851 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.82■■■□□ 2.2
PTPRS-207ENST00000589851 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.7■■■□□ 2.19
PTPRS-207ENST00000589851 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.67■■■□□ 2.18
PTPRS-207ENST00000589851 CFTRP13569 1480 aa28.65■■■□□ 2.18
PTPRS-207ENST00000589851 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.62■■■□□ 2.17
PTPRS-207ENST00000589851 CUX2O14529 1486 aa28.55■■■□□ 2.16
PTPRS-207ENST00000589851 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
PTPRS-207ENST00000589851 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
PTPRS-207ENST00000589851 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.47■■■□□ 2.15
PTPRS-207ENST00000589851 PRDM2Q13029 1718 aa28.46■■■□□ 2.15
PTPRS-207ENST00000589851 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.43■■■□□ 2.14
PTPRS-207ENST00000589851 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.4■■■□□ 2.14
PTPRS-207ENST00000589851 WDR62O43379 1518 aa28.31■■■□□ 2.12
PTPRS-207ENST00000589851 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
PTPRS-207ENST00000589851 ABCC8Q09428 1581 aa28.05■■■□□ 2.08
PTPRS-207ENST00000589851 TOPBP1Q92547 1522 aa28.02■■■□□ 2.08
PTPRS-207ENST00000589851 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.99■■■□□ 2.07
PTPRS-207ENST00000589851 IFT140Q96RY7 1462 aa27.85■■■□□ 2.05
PTPRS-207ENST00000589851 CUX1P39880 1505 aa27.81■■■□□ 2.04
PTPRS-207ENST00000589851 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
PTPRS-207ENST00000589851 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
PTPRS-207ENST00000589851 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
PTPRS-207ENST00000589851 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.7■■■□□ 2.03
PTPRS-207ENST00000589851 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.68■■■□□ 2.02
PTPRS-207ENST00000589851 SOGA1O94964 1423 aa27.67■■■□□ 2.02
PTPRS-207ENST00000589851 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.65■■■□□ 2.02
PTPRS-207ENST00000589851 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.64■■■□□ 2.02
PTPRS-207ENST00000589851 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
PTPRS-207ENST00000589851 TOP2BQ02880 1626 aa27.59■■■□□ 2.01
PTPRS-207ENST00000589851 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.59■■■□□ 2.01
PTPRS-207ENST00000589851 SYNJ1O43426 1573 aa27.56■■■□□ 2
PTPRS-207ENST00000589851 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.55■■■□□ 25e-10■■■■■ 72.7
PTPRS-207ENST00000589851 WDR97A6NE52 1622 aa27.52■■■□□ 2
PTPRS-207ENST00000589851 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
PTPRS-207ENST00000589851 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.46■■□□□ 1.99
PTPRS-207ENST00000589851 OSCARQ8IYS5 282 aa27.38■■□□□ 1.97
PTPRS-207ENST00000589851 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.36■■□□□ 1.97
PTPRS-207ENST00000589851 GRIN2BQ13224 1484 aa27.35■■□□□ 1.97
PTPRS-207ENST00000589851 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.34■■□□□ 1.97
PTPRS-207ENST00000589851 PBRM1Q86U86 1689 aa27.3■■□□□ 1.96
PTPRS-207ENST00000589851 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.29■■□□□ 1.96
PTPRS-207ENST00000589851 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
PTPRS-207ENST00000589851 CHD1O14646 1710 aa27.27■■□□□ 1.96
PTPRS-207ENST00000589851 FBLN2P98095 1184 aa27.21■■□□□ 1.95
PTPRS-207ENST00000589851 SYNJ2O15056 1496 aa27.18■■□□□ 1.94
PTPRS-207ENST00000589851 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
PTPRS-207ENST00000589851 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.14■■□□□ 1.94
PTPRS-207ENST00000589851 ADAMTS12P58397 1594 aa27.07■■□□□ 1.92
PTPRS-207ENST00000589851 KIF27Q86VH2 1401 aa27.06■■□□□ 1.92
PTPRS-207ENST00000589851 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.04■■□□□ 1.92
PTPRS-207ENST00000589851 GRIN2AQ12879 1464 aa26.99■■□□□ 1.91
PTPRS-207ENST00000589851 TRIM41Q8WV44 630 aa26.98■■□□□ 1.91
PTPRS-207ENST00000589851 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.97■■□□□ 1.91
PTPRS-207ENST00000589851 IGF1RP08069 1367 aa26.96■■□□□ 1.91
PTPRS-207ENST00000589851 ARHGEF11O15085 1522 aa26.91■■□□□ 1.9
PTPRS-207ENST00000589851 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.91■■□□□ 1.9
PTPRS-207ENST00000589851 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.91■■□□□ 1.9
PTPRS-207ENST00000589851 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.91■■□□□ 1.9
PTPRS-207ENST00000589851 CUL7Q14999 1698 aa26.89■■□□□ 1.9
PTPRS-207ENST00000589851 NUP160Q12769 1436 aa26.89■■□□□ 1.89
PTPRS-207ENST00000589851 CEP170Q5SW79 1584 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRS-207ENST00000589851 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRS-207ENST00000589851 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRS-207ENST00000589851 ARAP1Q96P48 1450 aa26.69■■□□□ 1.86
PTPRS-207ENST00000589851 SHROOM2Q13796 1616 aa26.68■■□□□ 1.86
PTPRS-207ENST00000589851 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.67■■□□□ 1.86
PTPRS-207ENST00000589851 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.66■■□□□ 1.86
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