Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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SEC23BQ15437 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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SEC23BQ15437 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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SEC23BQ15437 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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SEC23BQ15437 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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