Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
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BRD3Q15059 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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BRD3Q15059 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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BRD3Q15059 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRD3Q15059 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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