Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
BRD3Q15059 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
BRD3Q15059 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
BRD3Q15059 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
BRD3Q15059 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
BRD3Q15059 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
BRD3Q15059 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
BRD3Q15059 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
BRD3Q15059 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
BRD3Q15059 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
BRD3Q15059 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
BRD3Q15059 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
BRD3Q15059 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
BRD3Q15059 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
BRD3Q15059 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
BRD3Q15059 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
BRD3Q15059 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
BRD3Q15059 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
BRD3Q15059 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
BRD3Q15059 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
BRD3Q15059 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
BRD3Q15059 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
BRD3Q15059 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
BRD3Q15059 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
BRD3Q15059 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
BRD3Q15059 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
BRD3Q15059 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
BRD3Q15059 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
BRD3Q15059 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
BRD3Q15059 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
BRD3Q15059 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
BRD3Q15059 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
BRD3Q15059 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
BRD3Q15059 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
BRD3Q15059 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
BRD3Q15059 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
BRD3Q15059 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
BRD3Q15059 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
BRD3Q15059 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
BRD3Q15059 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
BRD3Q15059 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
BRD3Q15059 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
BRD3Q15059 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
BRD3Q15059 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
BRD3Q15059 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
BRD3Q15059 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
BRD3Q15059 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
BRD3Q15059 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
BRD3Q15059 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
BRD3Q15059 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
BRD3Q15059 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
BRD3Q15059 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
BRD3Q15059 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
BRD3Q15059 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
BRD3Q15059 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
BRD3Q15059 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
BRD3Q15059 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
BRD3Q15059 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
BRD3Q15059 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
BRD3Q15059 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
BRD3Q15059 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
BRD3Q15059 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
BRD3Q15059 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
BRD3Q15059 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
BRD3Q15059 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
BRD3Q15059 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
BRD3Q15059 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
BRD3Q15059 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
BRD3Q15059 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
BRD3Q15059 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
BRD3Q15059 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
BRD3Q15059 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
BRD3Q15059 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
BRD3Q15059 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
BRD3Q15059 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
BRD3Q15059 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
BRD3Q15059 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
BRD3Q15059 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
BRD3Q15059 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
BRD3Q15059 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
BRD3Q15059 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
BRD3Q15059 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
BRD3Q15059 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
BRD3Q15059 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
BRD3Q15059 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
BRD3Q15059 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
BRD3Q15059 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
BRD3Q15059 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
BRD3Q15059 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
BRD3Q15059 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
BRD3Q15059 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
BRD3Q15059 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
BRD3Q15059 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
BRD3Q15059 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
BRD3Q15059 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
BRD3Q15059 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
BRD3Q15059 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
BRD3Q15059 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
BRD3Q15059 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
BRD3Q15059 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
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