Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2BQ00403 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms