Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms