Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms