RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372333.3

ZCCHC24-201, Transcript of zinc finger CCHC-type containing 24, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ZCCHC24, Length 906 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC24-201ENST00000372333 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.14■■■■■ 4.98
ZCCHC24-201ENST00000372333 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.04■■■■■ 4.16
ZCCHC24-201ENST00000372333 ABCC9O60706 1549 aa39.92■■■■□ 3.98
ZCCHC24-201ENST00000372333 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.49■■■■□ 3.75
ZCCHC24-201ENST00000372333 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.46■■■■□ 3.75
ZCCHC24-201ENST00000372333 NACADO15069 1562 aa38.43■■■■□ 3.74
ZCCHC24-201ENST00000372333 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.4■■■■□ 3.74
ZCCHC24-201ENST00000372333 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.2■■■■□ 3.71
ZCCHC24-201ENST00000372333 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.13■■■■□ 3.69
ZCCHC24-201ENST00000372333 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.88■■■■□ 3.65
ZCCHC24-201ENST00000372333 SCRIBQ14160 1630 aa37.5■■■■□ 3.59
ZCCHC24-201ENST00000372333 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.38■■■■□ 3.58
ZCCHC24-201ENST00000372333 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.27■■■■□ 3.56
ZCCHC24-201ENST00000372333 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.81■■■■□ 3.48
ZCCHC24-201ENST00000372333 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.43■■■■□ 3.42
ZCCHC24-201ENST00000372333 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.33■■■■□ 3.41
ZCCHC24-201ENST00000372333 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.17■■■■□ 3.38
ZCCHC24-201ENST00000372333 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.97■■■■□ 3.35
ZCCHC24-201ENST00000372333 SMARCA4P51532 1647 aa35.85■■■■□ 3.33
ZCCHC24-201ENST00000372333 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.74■■■■□ 3.31
ZCCHC24-201ENST00000372333 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.62■■■■□ 3.29
ZCCHC24-201ENST00000372333 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.5■■■■□ 3.27
ZCCHC24-201ENST00000372333 SMARCA2P51531 1590 aa35.47■■■■□ 3.27
ZCCHC24-201ENST00000372333 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.43■■■■□ 3.26
ZCCHC24-201ENST00000372333 NCAPD3P42695 1498 aa35.41■■■■□ 3.26
ZCCHC24-201ENST00000372333 WIZO95785 1651 aa35.33■■■■□ 3.25
ZCCHC24-201ENST00000372333 HMGXB3Q12766 1538 aa35.33■■■■□ 3.25
ZCCHC24-201ENST00000372333 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
ZCCHC24-201ENST00000372333 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.2■■■■□ 3.23
ZCCHC24-201ENST00000372333 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.86■■■■□ 3.17
ZCCHC24-201ENST00000372333 NESP48681 1621 aa34.64■■■■□ 3.14
ZCCHC24-201ENST00000372333 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.53■■■■□ 3.12
ZCCHC24-201ENST00000372333 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.43■■■■□ 3.1
ZCCHC24-201ENST00000372333 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.42■■■■□ 3.1
ZCCHC24-201ENST00000372333 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.38■■■■□ 3.09
ZCCHC24-201ENST00000372333 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.36■■■■□ 3.09
ZCCHC24-201ENST00000372333 ERCC6Q03468 1493 aa34.33■■■■□ 3.09
ZCCHC24-201ENST00000372333 PRDM2Q13029 1718 aa34.28■■■■□ 3.08
ZCCHC24-201ENST00000372333 CFTRP13569 1480 aa34.25■■■■□ 3.07
ZCCHC24-201ENST00000372333 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.17■■■■□ 3.06
ZCCHC24-201ENST00000372333 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.12■■■■□ 3.05
ZCCHC24-201ENST00000372333 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.04■■■■□ 3.04
ZCCHC24-201ENST00000372333 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.98■■■■□ 3.03
ZCCHC24-201ENST00000372333 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.89■■■■□ 3.02
ZCCHC24-201ENST00000372333 CUX2O14529 1486 aa33.88■■■■□ 3.01
ZCCHC24-201ENST00000372333 WDR62O43379 1518 aa33.83■■■■□ 3.01
ZCCHC24-201ENST00000372333 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.75■■■□□ 2.99
ZCCHC24-201ENST00000372333 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.55■■■□□ 2.96
ZCCHC24-201ENST00000372333 TOPBP1Q92547 1522 aa33.55■■■□□ 2.96
ZCCHC24-201ENST00000372333 ABCC8Q09428 1581 aa33.45■■■□□ 2.95
ZCCHC24-201ENST00000372333 CUX1P39880 1505 aa33.41■■■□□ 2.94
ZCCHC24-201ENST00000372333 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.27■■■□□ 2.92
ZCCHC24-201ENST00000372333 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.24■■■□□ 2.91
ZCCHC24-201ENST00000372333 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.24■■■□□ 2.91
ZCCHC24-201ENST00000372333 IFT140Q96RY7 1462 aa33.23■■■□□ 2.91
ZCCHC24-201ENST00000372333 SYNJ1O43426 1573 aa33.22■■■□□ 2.91
ZCCHC24-201ENST00000372333 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.22■■■□□ 2.91
ZCCHC24-201ENST00000372333 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.17■■■□□ 2.9
ZCCHC24-201ENST00000372333 TOP2BQ02880 1626 aa33.17■■■□□ 2.9
ZCCHC24-201ENST00000372333 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.15■■■□□ 2.9
ZCCHC24-201ENST00000372333 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.15■■■□□ 2.9
ZCCHC24-201ENST00000372333 WDR97A6NE52 1622 aa33.1■■■□□ 2.89
ZCCHC24-201ENST00000372333 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.1■■■□□ 2.89
ZCCHC24-201ENST00000372333 SOGA1O94964 1423 aa33.07■■■□□ 2.88
ZCCHC24-201ENST00000372333 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.95■■■□□ 2.87
ZCCHC24-201ENST00000372333 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.89■■■□□ 2.86
ZCCHC24-201ENST00000372333 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.87■■■□□ 2.85
ZCCHC24-201ENST00000372333 PBRM1Q86U86 1689 aa32.86■■■□□ 2.85
ZCCHC24-201ENST00000372333 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.84■■■□□ 2.85
ZCCHC24-201ENST00000372333 CHD1O14646 1710 aa32.74■■■□□ 2.83
ZCCHC24-201ENST00000372333 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.73■■■□□ 2.83
ZCCHC24-201ENST00000372333 GRIN2BQ13224 1484 aa32.67■■■□□ 2.82
ZCCHC24-201ENST00000372333 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.67■■■□□ 2.82
ZCCHC24-201ENST00000372333 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.58■■■□□ 2.81
ZCCHC24-201ENST00000372333 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.56■■■□□ 2.8
ZCCHC24-201ENST00000372333 ADAMTS12P58397 1594 aa32.5■■■□□ 2.79
ZCCHC24-201ENST00000372333 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.5■■■□□ 2.79
ZCCHC24-201ENST00000372333 SYNJ2O15056 1496 aa32.46■■■□□ 2.79
ZCCHC24-201ENST00000372333 FBLN2P98095 1184 aa32.45■■■□□ 2.79
ZCCHC24-201ENST00000372333 TRIM41Q8WV44 630 aa32.45■■■□□ 2.79
ZCCHC24-201ENST00000372333 OSCARQ8IYS5 282 aa32.43■■■□□ 2.78
ZCCHC24-201ENST00000372333 KIF27Q86VH2 1401 aa32.43■■■□□ 2.78
ZCCHC24-201ENST00000372333 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.35■■■□□ 2.77
ZCCHC24-201ENST00000372333 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.33■■■□□ 2.77
ZCCHC24-201ENST00000372333 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.32■■■□□ 2.76
ZCCHC24-201ENST00000372333 CUL7Q14999 1698 aa32.31■■■□□ 2.76
ZCCHC24-201ENST00000372333 GRIN2AQ12879 1464 aa32.3■■■□□ 2.76
ZCCHC24-201ENST00000372333 IGF1RP08069 1367 aa32.27■■■□□ 2.76
ZCCHC24-201ENST00000372333 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.25■■■□□ 2.75
ZCCHC24-201ENST00000372333 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.22■■■□□ 2.75
ZCCHC24-201ENST00000372333 CEP170Q5SW79 1584 aa32.22■■■□□ 2.75
ZCCHC24-201ENST00000372333 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.12■■■□□ 2.73
ZCCHC24-201ENST00000372333 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.12■■■□□ 2.73
ZCCHC24-201ENST00000372333 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.12■■■□□ 2.73
ZCCHC24-201ENST00000372333 NUP160Q12769 1436 aa32.12■■■□□ 2.73
ZCCHC24-201ENST00000372333 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.08■■■□□ 2.73
ZCCHC24-201ENST00000372333 ARHGEF11O15085 1522 aa32.05■■■□□ 2.72
ZCCHC24-201ENST00000372333 SHROOM2Q13796 1616 aa31.97■■■□□ 2.71
ZCCHC24-201ENST00000372333 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.94■■■□□ 2.7
ZCCHC24-201ENST00000372333 EEA1Q15075 1411 aa31.89■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 178.1 ms