Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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