Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ERCC6Q03468 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERCC6Q03468 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms