RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375865.6

CSNK2B-201, Transcript of casein kinase 2 beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene CSNK2B, Length 908 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2B-201ENST00000375865 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.26■■■■□ 3.4
CSNK2B-201ENST00000375865 ABCC9O60706 1549 aa32.53■■■□□ 2.8
CSNK2B-201ENST00000375865 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.37■■■□□ 2.77
CSNK2B-201ENST00000375865 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.85■■■□□ 2.53
CSNK2B-201ENST00000375865 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.73■■■□□ 2.51
CSNK2B-201ENST00000375865 NACADO15069 1562 aa30.67■■■□□ 2.5
CSNK2B-201ENST00000375865 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.55■■■□□ 2.48
CSNK2B-201ENST00000375865 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.36■■■□□ 2.45
CSNK2B-201ENST00000375865 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.32■■■□□ 2.44
CSNK2B-201ENST00000375865 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.11■■■□□ 2.41
CSNK2B-201ENST00000375865 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.1■■■□□ 2.41
CSNK2B-201ENST00000375865 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
CSNK2B-201ENST00000375865 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.92■■■□□ 2.38
CSNK2B-201ENST00000375865 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.57■■■□□ 2.32
CSNK2B-201ENST00000375865 SCRIBQ14160 1630 aa29.56■■■□□ 2.32
CSNK2B-201ENST00000375865 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.34■■■□□ 2.29
CSNK2B-201ENST00000375865 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
CSNK2B-201ENST00000375865 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.29■■■□□ 2.28
CSNK2B-201ENST00000375865 NCAPD3P42695 1498 aa28.43■■■□□ 2.14
CSNK2B-201ENST00000375865 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.34■■■□□ 2.13
CSNK2B-201ENST00000375865 SMARCA4P51532 1647 aa28.21■■■□□ 2.11
CSNK2B-201ENST00000375865 SMARCA2P51531 1590 aa28.13■■■□□ 2.09
CSNK2B-201ENST00000375865 HMGXB3Q12766 1538 aa28.13■■■□□ 2.09
CSNK2B-201ENST00000375865 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.09■■■□□ 2.09
CSNK2B-201ENST00000375865 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
CSNK2B-201ENST00000375865 NESP48681 1621 aa28■■■□□ 2.07
CSNK2B-201ENST00000375865 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.99■■■□□ 2.07
CSNK2B-201ENST00000375865 CUX2O14529 1486 aa27.98■■■□□ 2.07
CSNK2B-201ENST00000375865 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.98■■■□□ 2.07
CSNK2B-201ENST00000375865 ERCC6Q03468 1493 aa27.97■■■□□ 2.07
CSNK2B-201ENST00000375865 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
CSNK2B-201ENST00000375865 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.65■■■□□ 2.02
CSNK2B-201ENST00000375865 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
CSNK2B-201ENST00000375865 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.56■■■□□ 2
CSNK2B-201ENST00000375865 WIZO95785 1651 aa27.56■■■□□ 2
CSNK2B-201ENST00000375865 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.53■■■□□ 2
CSNK2B-201ENST00000375865 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.46■■□□□ 1.99
CSNK2B-201ENST00000375865 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
CSNK2B-201ENST00000375865 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.31■■□□□ 1.96
CSNK2B-201ENST00000375865 WDR62O43379 1518 aa27.26■■□□□ 1.96
CSNK2B-201ENST00000375865 CFTRP13569 1480 aa27.25■■□□□ 1.95
CSNK2B-201ENST00000375865 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
CSNK2B-201ENST00000375865 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.2■■□□□ 1.95
CSNK2B-201ENST00000375865 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.17■■□□□ 1.94
CSNK2B-201ENST00000375865 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
CSNK2B-201ENST00000375865 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.99■■□□□ 1.91
CSNK2B-201ENST00000375865 TRIM41Q8WV44 630 aa26.77■■□□□ 1.88
CSNK2B-201ENST00000375865 OSCARQ8IYS5 282 aa26.74■■□□□ 1.87
CSNK2B-201ENST00000375865 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
CSNK2B-201ENST00000375865 TOPBP1Q92547 1522 aa26.7■■□□□ 1.86
CSNK2B-201ENST00000375865 PRDM2Q13029 1718 aa26.68■■□□□ 1.86
CSNK2B-201ENST00000375865 IFT140Q96RY7 1462 aa26.66■■□□□ 1.86
CSNK2B-201ENST00000375865 ABCC8Q09428 1581 aa26.54■■□□□ 1.84
CSNK2B-201ENST00000375865 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.54■■□□□ 1.84
CSNK2B-201ENST00000375865 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.46■■□□□ 1.831e-13■■■■□ 26.3
CSNK2B-201ENST00000375865 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
CSNK2B-201ENST00000375865 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
CSNK2B-201ENST00000375865 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
CSNK2B-201ENST00000375865 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.38■■□□□ 1.81
CSNK2B-201ENST00000375865 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.35■■□□□ 1.81
CSNK2B-201ENST00000375865 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.35■■□□□ 1.81
CSNK2B-201ENST00000375865 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.35■■□□□ 1.81
CSNK2B-201ENST00000375865 ARHGEF11O15085 1522 aa26.31■■□□□ 1.8
CSNK2B-201ENST00000375865 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
CSNK2B-201ENST00000375865 SOGA1O94964 1423 aa26.31■■□□□ 1.8
CSNK2B-201ENST00000375865 CUX1P39880 1505 aa26.26■■□□□ 1.79
CSNK2B-201ENST00000375865 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.25■■□□□ 1.79
CSNK2B-201ENST00000375865 FBLN2P98095 1184 aa26.19■■□□□ 1.78
CSNK2B-201ENST00000375865 CHD1O14646 1710 aa26.16■■□□□ 1.78
CSNK2B-201ENST00000375865 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.14■■□□□ 1.78
CSNK2B-201ENST00000375865 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.13■■□□□ 1.77
CSNK2B-201ENST00000375865 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
CSNK2B-201ENST00000375865 ARAP1Q96P48 1450 aa26.09■■□□□ 1.77
CSNK2B-201ENST00000375865 WDR97A6NE52 1622 aa26.06■■□□□ 1.76
CSNK2B-201ENST00000375865 GRIN2BQ13224 1484 aa26.04■■□□□ 1.76
CSNK2B-201ENST00000375865 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
CSNK2B-201ENST00000375865 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.01■■□□□ 1.75
CSNK2B-201ENST00000375865 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
CSNK2B-201ENST00000375865 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.96■■□□□ 1.75
CSNK2B-201ENST00000375865 SYNJ2O15056 1496 aa25.96■■□□□ 1.75
CSNK2B-201ENST00000375865 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.96■■□□□ 1.75
CSNK2B-201ENST00000375865 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.88■■□□□ 1.73
CSNK2B-201ENST00000375865 SYNJ1O43426 1573 aa25.87■■□□□ 1.73
CSNK2B-201ENST00000375865 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.82■■□□□ 1.72
CSNK2B-201ENST00000375865 PBRM1Q86U86 1689 aa25.8■■□□□ 1.72
CSNK2B-201ENST00000375865 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
CSNK2B-201ENST00000375865 TOP2BQ02880 1626 aa25.76■■□□□ 1.71
CSNK2B-201ENST00000375865 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.74■■□□□ 1.71
CSNK2B-201ENST00000375865 GRIN2AQ12879 1464 aa25.72■■□□□ 1.71
CSNK2B-201ENST00000375865 NUP160Q12769 1436 aa25.69■■□□□ 1.7
CSNK2B-201ENST00000375865 ADAMTS12P58397 1594 aa25.67■■□□□ 1.7
CSNK2B-201ENST00000375865 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.66■■□□□ 1.7
CSNK2B-201ENST00000375865 CEP170Q5SW79 1584 aa25.64■■□□□ 1.69
CSNK2B-201ENST00000375865 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.63■■□□□ 1.69
CSNK2B-201ENST00000375865 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.58■■□□□ 1.69
CSNK2B-201ENST00000375865 SHROOM2Q13796 1616 aa25.51■■□□□ 1.67
CSNK2B-201ENST00000375865 JPH4Q96JJ6 628 aa25.42■■□□□ 1.66
CSNK2B-201ENST00000375865 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
CSNK2B-201ENST00000375865 IGF1RP08069 1367 aa25.4■■□□□ 1.66
CSNK2B-201ENST00000375865 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11 ms