Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms