Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms