Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms