RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627177.1

WDR6-223, Transcript of WD repeat domain 6, human

TSL 2 BASIC

Gene WDR6, Length 207 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
WDR6-223	ENST00000627177	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		45	■■■■■ 4.79
WDR6-223	ENST00000627177	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		40.2	■■■■■ 4.03
WDR6-223	ENST00000627177	ABCC9	O60706	1549 aa		39.16	■■■■□ 3.86
WDR6-223	ENST00000627177	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		37.74	■■■■□ 3.63
WDR6-223	ENST00000627177	NACAD	O15069	1562 aa		37.68	■■■■□ 3.62
WDR6-223	ENST00000627177	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	37.54	■■■■□ 3.6
WDR6-223	ENST00000627177	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		37.48	■■■■□ 3.59
WDR6-223	ENST00000627177	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		37.3	■■■■□ 3.56
WDR6-223	ENST00000627177	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		37.21	■■■■□ 3.55
WDR6-223	ENST00000627177	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		37.08	■■■■□ 3.53
WDR6-223	ENST00000627177	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		36.69	■■■■□ 3.46
WDR6-223	ENST00000627177	SCRIB	Q14160	1630 aa		36.56	■■■■□ 3.44
WDR6-223	ENST00000627177	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	36.43	■■■■□ 3.42
WDR6-223	ENST00000627177	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		36.28	■■■■□ 3.4
WDR6-223	ENST00000627177	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		35.92	■■■■□ 3.34
WDR6-223	ENST00000627177	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	35.67	■■■■□ 3.3
WDR6-223	ENST00000627177	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		35.53	■■■■□ 3.28
WDR6-223	ENST00000627177	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		35.2	■■■■□ 3.23
WDR6-223	ENST00000627177	SMARCA4	P51532	1647 aa		35.01	■■■■□ 3.19
WDR6-223	ENST00000627177	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	34.89	■■■■□ 3.18
WDR6-223	ENST00000627177	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		34.73	■■■■□ 3.15
WDR6-223	ENST00000627177	SMARCA2	P51531	1590 aa		34.72	■■■■□ 3.15
WDR6-223	ENST00000627177	NCAPD3	P42695	1498 aa		34.71	■■■■□ 3.15
WDR6-223	ENST00000627177	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		34.7	■■■■□ 3.15
WDR6-223	ENST00000627177	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		34.68	■■■■□ 3.14
WDR6-223	ENST00000627177	HMGXB3	Q12766	1538 aa		34.65	■■■■□ 3.14
WDR6-223	ENST00000627177	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	34.43	■■■■□ 3.1
WDR6-223	ENST00000627177	WIZ	O95785	1651 aa		34.35	■■■■□ 3.09
WDR6-223	ENST00000627177	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	34.2	■■■■□ 3.06
WDR6-223	ENST00000627177	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	33.98	■■■■□ 3.03
WDR6-223	ENST00000627177	NES	P48681	1621 aa		33.91	■■■■□ 3.02
WDR6-223	ENST00000627177	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		33.89	■■■■□ 3.02
WDR6-223	ENST00000627177	ERCC6	Q03468	1493 aa		33.71	■■■□□ 2.99
WDR6-223	ENST00000627177	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		33.66	■■■□□ 2.98
WDR6-223	ENST00000627177	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		33.62	■■■□□ 2.97
WDR6-223	ENST00000627177	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	33.58	■■■□□ 2.97
WDR6-223	ENST00000627177	CFTR	P13569	1480 aa		33.5	■■■□□ 2.95
WDR6-223	ENST00000627177	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		33.5	■■■□□ 2.95
WDR6-223	ENST00000627177	CUX2	O14529	1486 aa		33.5	■■■□□ 2.95
WDR6-223	ENST00000627177	PRDM2	Q13029	1718 aa		33.49	■■■□□ 2.95
WDR6-223	ENST00000627177	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		33.47	■■■□□ 2.95
WDR6-223	ENST00000627177	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		33.31	■■■□□ 2.92
WDR6-223	ENST00000627177	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		33.28	■■■□□ 2.92
WDR6-223	ENST00000627177	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		33.27	■■■□□ 2.92
WDR6-223	ENST00000627177	WDR62	O43379	1518 aa		33.24	■■■□□ 2.91
WDR6-223	ENST00000627177	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	33.03	■■■□□ 2.88
WDR6-223	ENST00000627177	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88
WDR6-223	ENST00000627177	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		32.81	■■■□□ 2.84
WDR6-223	ENST00000627177	TOPBP1	Q92547	1522 aa		32.8	■■■□□ 2.84
WDR6-223	ENST00000627177	ABCC8	Q09428	1581 aa		32.73	■■■□□ 2.83
WDR6-223	ENST00000627177	IFT140	Q96RY7	1462 aa		32.57	■■■□□ 2.8
WDR6-223	ENST00000627177	CUX1	P39880	1505 aa		32.56	■■■□□ 2.8
WDR6-223	ENST00000627177	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	32.54	■■■□□ 2.8
WDR6-223	ENST00000627177	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	32.52	■■■□□ 2.8
WDR6-223	ENST00000627177	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	32.45	■■■□□ 2.78
WDR6-223	ENST00000627177	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.78
WDR6-223	ENST00000627177	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		32.42	■■■□□ 2.78
WDR6-223	ENST00000627177	WDR97	A6NE52	1622 aa		32.37	■■■□□ 2.77
WDR6-223	ENST00000627177	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		32.36	■■■□□ 2.77
WDR6-223	ENST00000627177	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		32.35	■■■□□ 2.77
WDR6-223	ENST00000627177	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		32.32	■■■□□ 2.76
WDR6-223	ENST00000627177	TOP2B	Q02880	1626 aa		32.29	■■■□□ 2.76
WDR6-223	ENST00000627177	SYNJ1	O43426	1573 aa		32.29	■■■□□ 2.76
WDR6-223	ENST00000627177	SOGA1	O94964	1423 aa		32.26	■■■□□ 2.75
WDR6-223	ENST00000627177	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	32.23	■■■□□ 2.75
WDR6-223	ENST00000627177	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	32.18	■■■□□ 2.74
WDR6-223	ENST00000627177	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		32.12	■■■□□ 2.73
WDR6-223	ENST00000627177	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		32.11	■■■□□ 2.73
WDR6-223	ENST00000627177	PBRM1	Q86U86	1689 aa		32.08	■■■□□ 2.73
WDR6-223	ENST00000627177	CHD1	O14646	1710 aa		32.07	■■■□□ 2.72
WDR6-223	ENST00000627177	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
WDR6-223	ENST00000627177	GRIN2B	Q13224	1484 aa		31.97	■■■□□ 2.71
WDR6-223	ENST00000627177	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		31.97	■■■□□ 2.71
WDR6-223	ENST00000627177	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		31.95	■■■□□ 2.7
WDR6-223	ENST00000627177	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	31.93	■■■□□ 2.7
WDR6-223	ENST00000627177	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		31.85	■■■□□ 2.69
WDR6-223	ENST00000627177	SYNJ2	O15056	1496 aa		31.79	■■■□□ 2.68
WDR6-223	ENST00000627177	ADAMTS12	P58397	1594 aa		31.79	■■■□□ 2.68
WDR6-223	ENST00000627177	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		31.75	■■■□□ 2.67
WDR6-223	ENST00000627177	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		31.7	■■■□□ 2.66
WDR6-223	ENST00000627177	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		31.64	■■■□□ 2.66
WDR6-223	ENST00000627177	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		31.64	■■■□□ 2.66
WDR6-223	ENST00000627177	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		31.64	■■■□□ 2.66
WDR6-223	ENST00000627177	FBLN2	P98095	1184 aa		31.61	■■■□□ 2.65
WDR6-223	ENST00000627177	GRIN2A	Q12879	1464 aa		31.59	■■■□□ 2.65
WDR6-223	ENST00000627177	ARHGEF11	O15085	1522 aa		31.59	■■■□□ 2.65
WDR6-223	ENST00000627177	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		31.57	■■■□□ 2.64
WDR6-223	ENST00000627177	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	31.56	■■■□□ 2.64
WDR6-223	ENST00000627177	KIF27	Q86VH2	1401 aa		31.52	■■■□□ 2.64
WDR6-223	ENST00000627177	CEP170	Q5SW79	1584 aa		31.51	■■■□□ 2.64
WDR6-223	ENST00000627177	CUL7	Q14999	1698 aa		31.51	■■■□□ 2.63
WDR6-223	ENST00000627177	NUP160	Q12769	1436 aa		31.48	■■■□□ 2.63
WDR6-223	ENST00000627177	IGF1R	P08069	1367 aa		31.38	■■■□□ 2.61
WDR6-223	ENST00000627177	SHROOM2	Q13796	1616 aa		31.36	■■■□□ 2.61
WDR6-223	ENST00000627177	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		31.34	■■■□□ 2.61
WDR6-223	ENST00000627177	ARAP1	Q96P48	1450 aa		31.33	■■■□□ 2.61
WDR6-223	ENST00000627177	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		31.21	■■■□□ 2.59
WDR6-223	ENST00000627177	TRIM41	Q8WV44	630 aa		31.19	■■■□□ 2.58
WDR6-223	ENST00000627177	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		31.17	■■■□□ 2.58
WDR6-223	ENST00000627177	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		31.09	■■■□□ 2.57

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