Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.51e-6■■■■□ 22.5
TBRG4Q969Z0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.381e-6■■■■□ 22.5
TBRG4Q969Z0 TNFRSF14-212ENST00000475523 1645 ntTSL 1 (best)21.87■■□□□ 1.094e-8■■■■□ 22.5
TBRG4Q969Z0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.794e-8■■■■□ 22.5
TBRG4Q969Z0 TNFRSF14-205ENST00000435221 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 218.4■□□□□ 0.544e-8■■■■□ 22.5
TBRG4Q969Z0 NT5DC2-215ENST00000492555 2004 ntTSL 1 (best)17.77■□□□□ 0.441e-6■■■■□ 22.5
TBRG4Q969Z0 TNFRSF14-207ENST00000451778 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 315.14■□□□□ 0.014e-8■■■■□ 22.5
TBRG4Q969Z0 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.014e-8■■■■□ 22.5
TBRG4Q969Z0 TNFRSF14-204ENST00000434817 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 314.5□□□□□ -0.094e-8■■■■□ 22.5
TBRG4Q969Z0 TNFRSF14-216ENST00000496064 1480 ntTSL 214.07□□□□□ -0.164e-8■■■■□ 22.5
TBRG4Q969Z0 TNFRSF14-214ENST00000482074 957 ntTSL 213.4□□□□□ -0.264e-8■■■■□ 22.5
TBRG4Q969Z0 TNFRSF14-206ENST00000442392 840 ntTSL 213.03□□□□□ -0.324e-8■■■■□ 22.5
TBRG4Q969Z0 TNFRSF14-203ENST00000426449 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 312.69□□□□□ -0.384e-8■■■■□ 22.5
TBRG4Q969Z0 NT5DC2-212ENST00000487779 536 ntTSL 312.55□□□□□ -0.41e-6■■■■□ 22.5
TBRG4Q969Z0 NT5DC2-201ENST00000307076 2047 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.481e-6■■■■□ 22.5
TBRG4Q969Z0 TNFRSF14-208ENST00000463471 4255 ntTSL 211.66□□□□□ -0.544e-8■■■■□ 22.5
TBRG4Q969Z0 CBFA2T3-210ENST00000569464 1327 ntTSL 1 (best)13.54□□□□□ -0.247e-7■■■■□ 22.5
TBRG4Q969Z0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.592e-6■■■■□ 22.4
TBRG4Q969Z0 CNOT11-202ENST00000420107 552 ntTSL 24.58□□□□□ -1.682e-6■■■■□ 22.4
TBRG4Q969Z0 CNOT11-203ENST00000462489 572 ntTSL 21.54□□□□□ -2.162e-6■■■■□ 22.4
TBRG4Q969Z0 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.235e-6■■■■□ 22.4
TBRG4Q969Z0 ACTR3-204ENST00000446821 818 ntTSL 316.23■□□□□ 0.195e-6■■■■□ 22.4
TBRG4Q969Z0 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.25e-6■■■■□ 22.4
TBRG4Q969Z0 ACTR3-202ENST00000415792 676 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.575e-6■■■■□ 22.4
TBRG4Q969Z0 ACTR3-206ENST00000484165 676 ntTSL 23.58□□□□□ -1.845e-6■■■■□ 22.4
TBRG4Q969Z0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.136e-7■■■■□ 22.4
TBRG4Q969Z0 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.016e-6■■■■□ 22.3
TBRG4Q969Z0 SMG1-202ENST00000446231 16115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.125e-6■■■■□ 22.3
TBRG4Q969Z0 SMG1-211ENST00000565324 12465 ntTSL 1 (best)5.55□□□□□ -1.525e-6■■■■□ 22.3
TBRG4Q969Z0 PAPD7-206ENST00000515721 603 ntTSL 326.86■■□□□ 1.894e-6■■■■□ 22.2
TBRG4Q969Z0 KCMF1-204ENST00000456682 661 ntTSL 325.78■■□□□ 1.722e-6■■■■□ 22.2
TBRG4Q969Z0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.422e-9■■■■□ 22.2
TBRG4Q969Z0 MYCBP2-209ENST00000491491 649 ntTSL 523.68■■□□□ 1.382e-6■■■■□ 22.2
TBRG4Q969Z0 RNASET2-204ENST00000421787 1924 ntTSL 220.38■□□□□ 0.852e-9■■■■□ 22.2
TBRG4Q969Z0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.812e-9■■■■□ 22.2
TBRG4Q969Z0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.682e-9■■■■□ 22.2
TBRG4Q969Z0 RNASET2-201ENST00000028008 1220 ntTSL 518.18■□□□□ 0.52e-9■■■■□ 22.2
TBRG4Q969Z0 KCMF1-202ENST00000428691 560 ntTSL 217.99■□□□□ 0.472e-6■■■■□ 22.2
TBRG4Q969Z0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.452e-6■■■■□ 22.2
TBRG4Q969Z0 RNASET2-207ENST00000478180 963 ntTSL 517.65■□□□□ 0.422e-9■■■■□ 22.2
TBRG4Q969Z0 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.262e-9■■■■□ 22.2
TBRG4Q969Z0 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.372e-6■■■■□ 22.2
TBRG4Q969Z0 CHST15-202ENST00000435907 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.442e-6■■■■□ 22.2
TBRG4Q969Z0 CHST15-205ENST00000628426 3553 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.592e-6■■■■□ 22.2
TBRG4Q969Z0 MYCBP2-201ENST00000357337 14736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.962e-6■■■■□ 22.2
TBRG4Q969Z0 SLC2A9-204ENST00000503280 584 ntTSL 47.47□□□□□ -1.211e-6■■■■□ 22.2
TBRG4Q969Z0 SLC2A9-212ENST00000512342 967 ntTSL 37.37□□□□□ -1.231e-6■■■■□ 22.2
TBRG4Q969Z0 SLC2A9-205ENST00000503803 644 ntTSL 36.78□□□□□ -1.321e-6■■■■□ 22.2
TBRG4Q969Z0 KCMF1-203ENST00000453448 625 ntTSL 35.53□□□□□ -1.522e-6■■■■□ 22.2
TBRG4Q969Z0 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.52e-6■■■■□ 22.1
TBRG4Q969Z0 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.242e-6■■■■□ 22.1
TBRG4Q969Z0 ACSL4-204ENST00000469796 5225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.22e-6■■■■□ 22.1
TBRG4Q969Z0 UBOX5-202ENST00000348031 4469 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.333e-6■■■■□ 22
TBRG4Q969Z0 UBOX5-201ENST00000217173 4631 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.433e-6■■■■□ 22
TBRG4Q969Z0 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.252e-6■■■■□ 22
TBRG4Q969Z0 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.132e-6■■■■□ 22
TBRG4Q969Z0 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.222e-6■■■■□ 22
TBRG4Q969Z0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.663e-6■■■■□ 22
TBRG4Q969Z0 ITPR2-201ENST00000242737 581 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.653e-6■■■■□ 22
TBRG4Q969Z0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.442e-6■■■■□ 22
TBRG4Q969Z0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.42e-6■■■■□ 22
TBRG4Q969Z0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.322e-6■■■■□ 22
TBRG4Q969Z0 PXMP2-202ENST00000428960 762 ntTSL 316.16■□□□□ 0.182e-6■■■■□ 22
TBRG4Q969Z0 PXMP2-204ENST00000539093 516 ntTSL 315.11■□□□□ 0.012e-6■■■■□ 22
TBRG4Q969Z0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.736e-8■■■■□ 21.9
TBRG4Q969Z0 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.143e-6■■■■□ 21.9
TBRG4Q969Z0 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.143e-6■■■■□ 21.9
TBRG4Q969Z0 TNS1-220ENST00000611415 6509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.363e-6■■■■□ 21.9
TBRG4Q969Z0 TNS1-221ENST00000615025 6488 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.513e-6■■■■□ 21.9
TBRG4Q969Z0 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.211e-12■■■■□ 21.9
TBRG4Q969Z0 PEG10-207ENST00000613043 574 ntTSL 512.58□□□□□ -0.41e-12■■■■□ 21.9
TBRG4Q969Z0 PEG10-204ENST00000493935 763 ntTSL 412.1□□□□□ -0.471e-12■■■■□ 21.9
TBRG4Q969Z0 PEG10-203ENST00000488574 2587 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.541e-12■■■■□ 21.9
TBRG4Q969Z0 PEG10-208ENST00000615790 6394 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.81e-12■■■■□ 21.9
TBRG4Q969Z0 PEG10-206ENST00000612941 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.91e-12■■■■□ 21.9
TBRG4Q969Z0 PEG10-209ENST00000617526 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.91e-12■■■■□ 21.9
TBRG4Q969Z0 PEG10-202ENST00000482108 6618 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.931e-12■■■■□ 21.9
TBRG4Q969Z0 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.581e-6■■■■□ 21.9
TBRG4Q969Z0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.571e-6■■■■□ 21.9
TBRG4Q969Z0 PHRF1-206ENST00000534320 5178 ntTSL 518.1■□□□□ 0.491e-6■■■■□ 21.9
TBRG4Q969Z0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.411e-6■■■■□ 21.9
TBRG4Q969Z0 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.241e-6■■■■□ 21.9
TBRG4Q969Z0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.541e-8■■■■□ 21.7
TBRG4Q969Z0 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.353e-7■■■■□ 21.7
TBRG4Q969Z0 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.462e-7■■■■□ 21.6
TBRG4Q969Z0 RPL38-206ENST00000533498 532 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.592e-7■■■■□ 21.6
TBRG4Q969Z0 RPL38-201ENST00000311111 1170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.872e-7■■■■□ 21.6
TBRG4Q969Z0 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.712e-7■■■■□ 21.6
TBRG4Q969Z0 EVL-222ENST00000557153 590 ntTSL 46.35□□□□□ -1.392e-6■■■■□ 21.6
TBRG4Q969Z0 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.32e-6■■■■□ 21.6
TBRG4Q969Z0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.13e-8■■■■□ 21.6
TBRG4Q969Z0 ARID3A-204ENST00000585895 377 ntTSL 225.83■■□□□ 1.733e-8■■■■□ 21.6
TBRG4Q969Z0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.63e-8■■■■□ 21.6
TBRG4Q969Z0 SETD5-209ENST00000431285 1824 ntTSL 524■■□□□ 1.433e-8■■■■□ 21.6
TBRG4Q969Z0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.363e-8■■■■□ 21.6
TBRG4Q969Z0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.343e-8■■■■□ 21.6
TBRG4Q969Z0 ENGASE-210ENST00000585160 284 ntTSL 322.65■■□□□ 1.223e-8■■■■□ 21.6
TBRG4Q969Z0 ANXA5-206ENST00000511552 1036 ntTSL 321.65■■□□□ 1.063e-8■■■■□ 21.6
TBRG4Q969Z0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.018e-6■■■■□ 21.6
TBRG4Q969Z0 SVIL-AS1-205ENST00000430295 440 ntTSL 221.03■□□□□ 0.963e-8■■■■□ 21.6
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