Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms