Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS26

SPANXA1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome A, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXA1Q9NS26 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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SPANXA1Q9NS26 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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SPANXA1Q9NS26 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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SPANXA1Q9NS26 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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SPANXA1Q9NS26 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPANXA1Q9NS26 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SPANXA1Q9NS26 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SPANXA1Q9NS26 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SPANXA1Q9NS26 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
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