Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASGRF1Q13972 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms