Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

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Length 1,273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC42.02■■■■■ 4.32
RASGRF1Q13972 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
RASGRF1Q13972 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC40.81■■■■■ 4.12
RASGRF1Q13972 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
RASGRF1Q13972 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
RASGRF1Q13972 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
RASGRF1Q13972 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
RASGRF1Q13972 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.09■■■■■ 4.01
RASGRF1Q13972 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
RASGRF1Q13972 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
RASGRF1Q13972 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
RASGRF1Q13972 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
RASGRF1Q13972 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
RASGRF1Q13972 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
RASGRF1Q13972 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC39.03■■■■□ 3.84
RASGRF1Q13972 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
RASGRF1Q13972 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC38.9■■■■□ 3.82
RASGRF1Q13972 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
RASGRF1Q13972 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
RASGRF1Q13972 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
RASGRF1Q13972 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
RASGRF1Q13972 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
RASGRF1Q13972 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
RASGRF1Q13972 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
RASGRF1Q13972 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
RASGRF1Q13972 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
RASGRF1Q13972 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
RASGRF1Q13972 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
RASGRF1Q13972 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
RASGRF1Q13972 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
RASGRF1Q13972 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
RASGRF1Q13972 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
RASGRF1Q13972 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
RASGRF1Q13972 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
RASGRF1Q13972 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
RASGRF1Q13972 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
RASGRF1Q13972 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
RASGRF1Q13972 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
RASGRF1Q13972 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
RASGRF1Q13972 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
RASGRF1Q13972 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
RASGRF1Q13972 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
RASGRF1Q13972 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
RASGRF1Q13972 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
RASGRF1Q13972 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
RASGRF1Q13972 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
RASGRF1Q13972 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
RASGRF1Q13972 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
RASGRF1Q13972 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
RASGRF1Q13972 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
RASGRF1Q13972 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
RASGRF1Q13972 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
RASGRF1Q13972 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
RASGRF1Q13972 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
RASGRF1Q13972 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
RASGRF1Q13972 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
RASGRF1Q13972 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
RASGRF1Q13972 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
RASGRF1Q13972 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RASGRF1Q13972 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
RASGRF1Q13972 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
RASGRF1Q13972 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
RASGRF1Q13972 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
RASGRF1Q13972 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
RASGRF1Q13972 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
RASGRF1Q13972 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RASGRF1Q13972 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RASGRF1Q13972 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RASGRF1Q13972 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
RASGRF1Q13972 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RASGRF1Q13972 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
RASGRF1Q13972 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
RASGRF1Q13972 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
RASGRF1Q13972 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
RASGRF1Q13972 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
RASGRF1Q13972 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
RASGRF1Q13972 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
RASGRF1Q13972 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
RASGRF1Q13972 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
RASGRF1Q13972 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
RASGRF1Q13972 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
RASGRF1Q13972 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
RASGRF1Q13972 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
RASGRF1Q13972 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
RASGRF1Q13972 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
RASGRF1Q13972 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
RASGRF1Q13972 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
RASGRF1Q13972 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
RASGRF1Q13972 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
RASGRF1Q13972 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
RASGRF1Q13972 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
RASGRF1Q13972 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
RASGRF1Q13972 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
RASGRF1Q13972 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
RASGRF1Q13972 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
RASGRF1Q13972 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
RASGRF1Q13972 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
RASGRF1Q13972 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
RASGRF1Q13972 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
RASGRF1Q13972 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
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