Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms