Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms