Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.644e-7■■■■■ 138.2
UTP3Q9NQZ2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.614e-7■■■■■ 138.2
UTP3Q9NQZ2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.484e-7■■■■■ 138.2
UTP3Q9NQZ2 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 138.2
UTP3Q9NQZ2 SUN2-202ENST00000405510 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.161e-6■■■■■ 138.2
UTP3Q9NQZ2 RBM20-201ENST00000369519 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 138.1
UTP3Q9NQZ2 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 138
UTP3Q9NQZ2 LIMD1-203ENST00000465039 676 ntTSL 514.52□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 138
UTP3Q9NQZ2 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.053e-7■■■■■ 137.9
UTP3Q9NQZ2 CCNH-203ENST00000504878 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.363e-7■■■■■ 137.9
UTP3Q9NQZ2 CCNH-210ENST00000513499 606 ntTSL 38.49□□□□□ -1.053e-7■■■■■ 137.9
UTP3Q9NQZ2 CCNH-204ENST00000505230 587 ntTSL 26.76□□□□□ -1.333e-7■■■■■ 137.9
UTP3Q9NQZ2 CCNH-207ENST00000510020 582 ntTSL 35.64□□□□□ -1.513e-7■■■■■ 137.9
UTP3Q9NQZ2 NECAB3-211ENST00000485399 1373 ntTSL 223.4■■□□□ 1.341e-6■■■■■ 137.9
UTP3Q9NQZ2 NECAB3-222ENST00000607805 969 ntTSL 522.14■■□□□ 1.131e-6■■■■■ 137.9
UTP3Q9NQZ2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.111e-6■■■■■ 137.9
UTP3Q9NQZ2 NECAB3-213ENST00000488489 2142 ntTSL 221.91■■□□□ 1.11e-6■■■■■ 137.9
UTP3Q9NQZ2 NECAB3-219ENST00000606690 900 ntTSL 515.17■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 137.9
UTP3Q9NQZ2 NECAB3-203ENST00000439478 925 ntTSL 515.17■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 137.9
UTP3Q9NQZ2 ERAP1-205ENST00000507154 583 ntTSL 324.86■■□□□ 1.572e-6■■■■■ 137.8
UTP3Q9NQZ2 ERAP1-207ENST00000508227 555 ntTSL 424.86■■□□□ 1.572e-6■■■■■ 137.8
UTP3Q9NQZ2 HIP1R-207ENST00000536847 1233 ntTSL 321.48■■□□□ 1.032e-6■■■■■ 137.8
UTP3Q9NQZ2 DNAJB6-212ENST00000465908 694 ntTSL 317.26■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 137.8
UTP3Q9NQZ2 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 137.8
UTP3Q9NQZ2 ANKRD23-205ENST00000476975 1132 ntTSL 514.47□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 137.8
UTP3Q9NQZ2 HIP1R-206ENST00000536772 538 ntTSL 214.41□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 137.8
UTP3Q9NQZ2 CTAGE5-202ENST00000280083 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 137.8
UTP3Q9NQZ2 CTAGE5-206ENST00000396158 3695 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 137.8
UTP3Q9NQZ2 CTAGE5-214ENST00000556148 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.592e-6■■■■■ 137.8
UTP3Q9NQZ2 CTAGE5-203ENST00000341502 4091 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.62e-6■■■■■ 137.8
UTP3Q9NQZ2 CTAGE5-205ENST00000348007 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.792e-6■■■■■ 137.8
UTP3Q9NQZ2 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.382e-6■■■■■ 137.8
UTP3Q9NQZ2 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.412e-6■■■■■ 137.8
UTP3Q9NQZ2 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.432e-6■■■■■ 137.8
UTP3Q9NQZ2 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.442e-6■■■■■ 137.8
UTP3Q9NQZ2 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.462e-6■■■■■ 137.8
UTP3Q9NQZ2 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.522e-6■■■■■ 137.8
UTP3Q9NQZ2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.181e-6■■■■■ 137.8
UTP3Q9NQZ2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.671e-6■■■■■ 137.8
UTP3Q9NQZ2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.381e-6■■■■■ 137.8
UTP3Q9NQZ2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.9■■□□□ 1.261e-10■■■■■ 137.8
UTP3Q9NQZ2 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.466e-7■■■■■ 137.8
UTP3Q9NQZ2 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.296e-7■■■■■ 137.8
UTP3Q9NQZ2 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.266e-7■■■■■ 137.8
UTP3Q9NQZ2 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.146e-7■■■■■ 137.8
UTP3Q9NQZ2 BCAR1-211ENST00000562556 4659 ntTSL 215.05■□□□□ 06e-7■■■■■ 137.8
UTP3Q9NQZ2 BCAR1-203ENST00000393422 4064 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.186e-7■■■■■ 137.8
UTP3Q9NQZ2 NTRK1-204ENST00000489021 570 ntTSL 411.19□□□□□ -0.626e-7■■■■■ 137.8
UTP3Q9NQZ2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.463e-7■■■■■ 137.8
UTP3Q9NQZ2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.233e-7■■■■■ 137.8
UTP3Q9NQZ2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.133e-7■■■■■ 137.8
UTP3Q9NQZ2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.13e-7■■■■■ 137.8
UTP3Q9NQZ2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.13e-7■■■■■ 137.8
UTP3Q9NQZ2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.53e-7■■■■■ 137.8
UTP3Q9NQZ2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.453e-7■■■■■ 137.8
UTP3Q9NQZ2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.63e-7■■■■■ 137.8
UTP3Q9NQZ2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 137.7
UTP3Q9NQZ2 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 137.7
UTP3Q9NQZ2 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.012e-6■■■■■ 137.7
UTP3Q9NQZ2 PUM3-202ENST00000397885 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.424e-14■■■■■ 137.7
UTP3Q9NQZ2 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.487e-7■■■■■ 137.6
UTP3Q9NQZ2 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 137.6
UTP3Q9NQZ2 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.056e-7■■■■■ 137.6
UTP3Q9NQZ2 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.116e-7■■■■■ 137.6
UTP3Q9NQZ2 EHD1-213ENST00000621096 3336 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.246e-7■■■■■ 137.6
UTP3Q9NQZ2 TACC1-208ENST00000520340 1976 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.121e-7■■■■■ 137.6
UTP3Q9NQZ2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.421e-6■■■■■ 137.6
UTP3Q9NQZ2 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.021e-6■■■■■ 137.5
UTP3Q9NQZ2 NFE2L2-211ENST00000464747 2749 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.452e-6■■■■■ 137.5
UTP3Q9NQZ2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.038e-7■■■■■ 137.5
UTP3Q9NQZ2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.488e-7■■■■■ 137.5
UTP3Q9NQZ2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21e-6■■■■■ 137.5
UTP3Q9NQZ2 MGAT4B-222ENST00000523329 543 ntTSL 318.45■□□□□ 0.548e-7■■■■■ 137.4
UTP3Q9NQZ2 FADS3-202ENST00000414624 1452 ntTSL 218.34■□□□□ 0.532e-13■■■■■ 137.4
UTP3Q9NQZ2 PDIA2-207ENST00000482665 1956 ntTSL 1 (best)24.71■■□□□ 1.551e-10■■■■■ 137.3
UTP3Q9NQZ2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.461e-10■■■■■ 137.3
UTP3Q9NQZ2 PDIA2-206ENST00000467212 1750 ntTSL 221.67■■□□□ 1.061e-10■■■■■ 137.3
UTP3Q9NQZ2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.741e-10■■■■■ 137.3
UTP3Q9NQZ2 RSRC1-212ENST00000482822 792 ntTSL 28.8□□□□□ -11e-6■■■■■ 137.3
UTP3Q9NQZ2 UBAP2-212ENST00000629575 3460 ntTSL 29.1□□□□□ -0.951e-6■■■■■ 137.2
UTP3Q9NQZ2 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.041e-6■■■■■ 137.2
UTP3Q9NQZ2 UBAP2-204ENST00000379238 4289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.041e-6■■■■■ 137.2
UTP3Q9NQZ2 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.151e-6■■■■■ 137.2
UTP3Q9NQZ2 CIT-203ENST00000392521 8708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 137.2
UTP3Q9NQZ2 CIT-201ENST00000261833 8578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.591e-6■■■■■ 137.2
UTP3Q9NQZ2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.837e-7■■■■■ 137.1
UTP3Q9NQZ2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.127e-7■■■■■ 137.1
UTP3Q9NQZ2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.117e-7■■■■■ 137.1
UTP3Q9NQZ2 KAZN-206ENST00000491547 5592 ntTSL 221.88■■□□□ 1.097e-7■■■■■ 137.1
UTP3Q9NQZ2 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.113e-8■■■■■ 137.1
UTP3Q9NQZ2 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.192e-7■■■■■ 137.1
UTP3Q9NQZ2 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.062e-7■■■■■ 137.1
UTP3Q9NQZ2 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.022e-7■■■■■ 137.1
UTP3Q9NQZ2 CCHCR1-206ENST00000448141 664 ntTSL 322.01■■□□□ 1.114e-7■■■■■ 137
UTP3Q9NQZ2 CCHCR1-226ENST00000508683 567 ntTSL 421.35■■□□□ 1.014e-7■■■■■ 137
UTP3Q9NQZ2 CCHCR1-207ENST00000448162 699 ntTSL 521.15■□□□□ 0.984e-7■■■■■ 137
UTP3Q9NQZ2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.734e-7■■■■■ 137
UTP3Q9NQZ2 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.545e-8■■■■■ 137
UTP3Q9NQZ2 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.163e-6■■■■■ 137
UTP3Q9NQZ2 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.13e-6■■■■■ 137
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 1418 ms