Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms