Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.613e-68■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 LENG8-203ENST00000421200 594 ntTSL 317.88■□□□□ 0.453e-68■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.393e-68■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.333e-68■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.123e-68■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.29e-9■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.169e-9■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.419e-9■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 SUMO3-206ENST00000479153 1736 ntTSL 215.27■□□□□ 0.049e-9■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 RPL24-201ENST00000394077 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.693e-8■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 RPL24-202ENST00000464595 668 ntTSL 1 (best)9.49□□□□□ -0.893e-8■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.163e-8■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 EIF3E-215ENST00000522445 841 ntTSL 38.69□□□□□ -1.029e-13■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 EIF3E-211ENST00000521440 746 ntTSL 1 (best)7.84□□□□□ -1.159e-13■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 TRMT2A-220ENST00000494820 1098 ntTSL 519.09■□□□□ 0.652e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 MKRN1-214ENST00000495305 1390 ntTSL 233.92■■■■□ 3.021e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.341e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 MKRN1-215ENST00000496169 1625 ntTSL 227.91■■■□□ 2.061e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 PABPN1-206ENST00000556809 969 ntTSL 226.86■■□□□ 1.893e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.771e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.711e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.21e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.911e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.841e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 SNHG17-205ENST00000424235 764 ntTSL 219.49■□□□□ 0.711e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.71e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.694e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.681e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.411e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 TRAPPC2L-208ENST00000564547 980 ntTSL 217.27■□□□□ 0.361e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.221e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.111e-14■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 CIZ1-215ENST00000475471 836 ntTSL 215.72■□□□□ 0.112e-8■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 TUBG1-204ENST00000589688 1505 ntTSL 515.26■□□□□ 0.031e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 SNHG17-202ENST00000414142 2102 ntTSL 215.26■□□□□ 0.031e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.011e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 ZMPSTE24-201ENST00000372759 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.11e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 TRAPPC2L-215ENST00000625770 281 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.191e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 FBXW11-201ENST00000265094 4342 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.331e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 MKRN1-211ENST00000480552 906 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.491e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 PABPN1-208ENST00000557702 778 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.53e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 ZNF217-204ENST00000437222 746 ntTSL 211.53□□□□□ -0.561e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 AK3-204ENST00000611749 4029 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.651e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 MKRN1-205ENST00000468447 583 ntTSL 1 (best)10.8□□□□□ -0.681e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 CIZ1-216ENST00000476239 853 ntTSL 510.7□□□□□ -0.72e-8■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 SNHG17-204ENST00000423536 517 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.751e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 ACTL6A-204ENST00000461125 457 ntTSL 27.15□□□□□ -1.262e-9■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 EIF1B-204ENST00000488260 637 ntTSL 26.59□□□□□ -1.351e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 EIF1B-202ENST00000462088 873 ntTSL 26.39□□□□□ -1.391e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 EIF1B-203ENST00000487151 632 ntTSL 26□□□□□ -1.451e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.465e-7■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.627e-14■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 MRPS21-202ENST00000614145 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.467e-14■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 GLRX5-202ENST00000553672 912 ntTSL 29.64□□□□□ -0.872e-9■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 FAM173A-205ENST00000566525 1686 ntTSL 228.87■■■□□ 2.211e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.161e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.071e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.991e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.471e-7■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.542e-8■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.161e-16■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.151e-16■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 EIF3F-202ENST00000528653 739 ntTSL 215.97■□□□□ 0.151e-16■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 EIF3F-205ENST00000531329 1072 ntTSL 215.75■□□□□ 0.111e-16■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 EIF3F-208ENST00000533626 7540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.831e-16■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 MAP1LC3B-206ENST00000564844 3085 ntTSL 1 (best)22.29■■□□□ 1.163e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.353e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.437e-15■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.317e-15■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 PPIE-210ENST00000475350 1213 ntTSL 211.78□□□□□ -0.527e-15■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 PPIE-201ENST00000324379 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.67e-15■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 PPIE-212ENST00000482751 2564 ntTSL 210.42□□□□□ -0.747e-15■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 PPIE-214ENST00000495526 4651 ntTSL 1 (best)8.78□□□□□ -17e-15■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 SMARCC1-202ENST00000425518 3827 ntTSL 28.25□□□□□ -1.097e-9■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.51e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 THAP7-206ENST00000476667 1671 ntTSL 522.84■■□□□ 1.251e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 THAP7-208ENST00000498406 1957 ntTSL 222.4■■□□□ 1.181e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 THAP7-204ENST00000471073 1809 ntTSL 221.34■■□□□ 1.011e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.841e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 THAP7-207ENST00000488975 507 ntTSL 517.31■□□□□ 0.364e-8■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 CCAR1-218ENST00000630771 4540 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.982e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.282e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 ATP6V0D1-202ENST00000426604 1257 ntTSL 213.55□□□□□ -0.247e-9■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 TMEM256-PLSCR3-203ENST00000571125 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 523.8■■□□□ 1.42e-11■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 TMEM256-202ENST00000575427 403 ntTSL 215.31■□□□□ 0.042e-11■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 ZCRB1-201ENST00000266529 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.038e-16■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.989e-11■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 TRIP6-206ENST00000476870 1750 ntTSL 220.78■□□□□ 0.929e-11■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.749e-11■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 MKRN1-209ENST00000475010 3467 ntTSL 215.16■□□□□ 0.027e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.027e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 ZNF217-201ENST00000302342 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.616e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 ZNF217-202ENST00000371471 5796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.636e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.236e-30■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.236e-30■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.543e-6■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.254e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.944e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.874e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.74e-7■■□□□ 13.3
Retrieved 100 of 23,669 protein–RNA pairs in 212.3 ms