RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496169.5

MKRN1-215, Transcript of makorin ring finger protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene MKRN1, Length 1,625 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN1-215ENST00000496169 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.95■■■■■ 6.71
MKRN1-215ENST00000496169 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.74■■■■■ 5.71
MKRN1-215ENST00000496169 ABCC9O60706 1549 aa49.93■■■■■ 5.58
MKRN1-215ENST00000496169 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.89■■■■■ 5.26
MKRN1-215ENST00000496169 NACADO15069 1562 aa47.76■■■■■ 5.24
MKRN1-215ENST00000496169 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.76■■■■■ 5.24
MKRN1-215ENST00000496169 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.37■■■■■ 5.17
MKRN1-215ENST00000496169 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.37■■■■■ 5.17
MKRN1-215ENST00000496169 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.08■■■■■ 5.13
MKRN1-215ENST00000496169 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.89■■■■■ 5.1
MKRN1-215ENST00000496169 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.64■■■■■ 5.06
MKRN1-215ENST00000496169 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.48■■■■■ 5.03
MKRN1-215ENST00000496169 SCRIBQ14160 1630 aa46.3■■■■■ 5
MKRN1-215ENST00000496169 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.11■■■■■ 4.97
MKRN1-215ENST00000496169 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.88■■■■■ 4.93
MKRN1-215ENST00000496169 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.26■■■■■ 4.84
MKRN1-215ENST00000496169 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.16■■■■■ 4.82
MKRN1-215ENST00000496169 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.87■■■■■ 4.77
MKRN1-215ENST00000496169 SMARCA4P51532 1647 aa44.26■■■■■ 4.68
MKRN1-215ENST00000496169 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.15■■■■■ 4.66
MKRN1-215ENST00000496169 NCAPD3P42695 1498 aa44.08■■■■■ 4.65
MKRN1-215ENST00000496169 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.07■■■■■ 4.65
MKRN1-215ENST00000496169 SMARCA2P51531 1590 aa43.99■■■■■ 4.63
MKRN1-215ENST00000496169 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.91■■■■■ 4.62
MKRN1-215ENST00000496169 HMGXB3Q12766 1538 aa43.82■■■■■ 4.61
MKRN1-215ENST00000496169 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.81■■■■■ 4.6
MKRN1-215ENST00000496169 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.69■■■■■ 4.58
MKRN1-215ENST00000496169 WIZO95785 1651 aa43.45■■■■■ 4.55
MKRN1-215ENST00000496169 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.3■■■■■ 4.52
MKRN1-215ENST00000496169 NESP48681 1621 aa43.14■■■■■ 4.5
MKRN1-215ENST00000496169 ERCC6Q03468 1493 aa43.03■■■■■ 4.48
MKRN1-215ENST00000496169 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.96■■■■■ 4.47
MKRN1-215ENST00000496169 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.91■■■■■ 4.46
MKRN1-215ENST00000496169 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.79■■■■■ 4.44
MKRN1-215ENST00000496169 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.68■■■■■ 4.42
MKRN1-215ENST00000496169 CUX2O14529 1486 aa42.65■■■■■ 4.42
MKRN1-215ENST00000496169 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.64■■■■■ 4.42
MKRN1-215ENST00000496169 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.52■■■■■ 4.4
MKRN1-215ENST00000496169 CFTRP13569 1480 aa42.48■■■■■ 4.39
MKRN1-215ENST00000496169 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.44■■■■■ 4.39
MKRN1-215ENST00000496169 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.3■■■■■ 4.36
MKRN1-215ENST00000496169 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.26■■■■■ 4.36
MKRN1-215ENST00000496169 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.25■■■■■ 4.35
MKRN1-215ENST00000496169 PRDM2Q13029 1718 aa42.18■■■■■ 4.34
MKRN1-215ENST00000496169 WDR62O43379 1518 aa42.12■■■■■ 4.33
MKRN1-215ENST00000496169 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.06■■■■■ 4.32
MKRN1-215ENST00000496169 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.9■■■■■ 4.3
MKRN1-215ENST00000496169 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.7■■■■■ 4.27
MKRN1-215ENST00000496169 TOPBP1Q92547 1522 aa41.6■■■■■ 4.25
MKRN1-215ENST00000496169 ABCC8Q09428 1581 aa41.57■■■■■ 4.24
MKRN1-215ENST00000496169 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.52■■■■■ 4.24
MKRN1-215ENST00000496169 IFT140Q96RY7 1462 aa41.38■■■■■ 4.21
MKRN1-215ENST00000496169 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.26■■■■■ 4.19
MKRN1-215ENST00000496169 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.23■■■■■ 4.19
MKRN1-215ENST00000496169 CUX1P39880 1505 aa41.2■■■■■ 4.19
MKRN1-215ENST00000496169 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.18■■■■■ 4.18
MKRN1-215ENST00000496169 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.09■■■■■ 4.17
MKRN1-215ENST00000496169 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.07■■■■■ 4.17
MKRN1-215ENST00000496169 SOGA1O94964 1423 aa41.07■■■■■ 4.16
MKRN1-215ENST00000496169 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.06■■■■■ 4.16
MKRN1-215ENST00000496169 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41■■■■■ 4.152e-7■□□□□ 10.5
MKRN1-215ENST00000496169 OSCARQ8IYS5 282 aa40.89■■■■■ 4.14
MKRN1-215ENST00000496169 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.13
MKRN1-215ENST00000496169 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.82■■■■■ 4.13
MKRN1-215ENST00000496169 WDR97A6NE52 1622 aa40.79■■■■■ 4.12
MKRN1-215ENST00000496169 TOP2BQ02880 1626 aa40.77■■■■■ 4.12
MKRN1-215ENST00000496169 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.77■■■■■ 4.12
MKRN1-215ENST00000496169 SYNJ1O43426 1573 aa40.76■■■■■ 4.12
MKRN1-215ENST00000496169 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.67■■■■■ 4.1
MKRN1-215ENST00000496169 CHD1O14646 1710 aa40.64■■■■■ 4.1
MKRN1-215ENST00000496169 GRIN2BQ13224 1484 aa40.6■■■■■ 4.09
MKRN1-215ENST00000496169 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.59■■■■■ 4.09
MKRN1-215ENST00000496169 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.58■■■■■ 4.09
MKRN1-215ENST00000496169 FBLN2P98095 1184 aa40.56■■■■■ 4.08
MKRN1-215ENST00000496169 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.54■■■■■ 4.08
MKRN1-215ENST00000496169 PBRM1Q86U86 1689 aa40.54■■■■■ 4.08
MKRN1-215ENST00000496169 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.5■■■■■ 4.07
MKRN1-215ENST00000496169 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.4■■■■■ 4.06
MKRN1-215ENST00000496169 SYNJ2O15056 1496 aa40.36■■■■■ 4.05
MKRN1-215ENST00000496169 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.26■■■■■ 4.04
MKRN1-215ENST00000496169 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.26■■■■■ 4.04
MKRN1-215ENST00000496169 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.26■■■■■ 4.04
MKRN1-215ENST00000496169 TRIM41Q8WV44 630 aa40.24■■■■■ 4.03
MKRN1-215ENST00000496169 ARHGEF11O15085 1522 aa40.21■■■■■ 4.03
MKRN1-215ENST00000496169 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.18■■■■■ 4.02
MKRN1-215ENST00000496169 ADAMTS12P58397 1594 aa40.16■■■■■ 4.02
MKRN1-215ENST00000496169 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.15■■■■■ 4.02
MKRN1-215ENST00000496169 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.09■■■■■ 4.01
MKRN1-215ENST00000496169 GRIN2AQ12879 1464 aa40.08■■■■■ 4.01
MKRN1-215ENST00000496169 KIF27Q86VH2 1401 aa39.99■■■■□ 3.99
MKRN1-215ENST00000496169 CEP170Q5SW79 1584 aa39.91■■■■□ 3.98
MKRN1-215ENST00000496169 NUP160Q12769 1436 aa39.9■■■■□ 3.98
MKRN1-215ENST00000496169 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.89■■■■□ 3.98
MKRN1-215ENST00000496169 IGF1RP08069 1367 aa39.88■■■■□ 3.98
MKRN1-215ENST00000496169 ARAP1Q96P48 1450 aa39.87■■■■□ 3.97
MKRN1-215ENST00000496169 CUL7Q14999 1698 aa39.77■■■■□ 3.96
MKRN1-215ENST00000496169 SHROOM2Q13796 1616 aa39.65■■■■□ 3.94
MKRN1-215ENST00000496169 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.64■■■■□ 3.94
MKRN1-215ENST00000496169 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.61■■■■□ 3.93
MKRN1-215ENST00000496169 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.6■■■■□ 3.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms