Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD34P28906 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD34P28906 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD34P28906 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD34P28906 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD34P28906 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD34P28906 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD34P28906 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD34P28906 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD34P28906 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD34P28906 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD34P28906 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD34P28906 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD34P28906 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD34P28906 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD34P28906 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD34P28906 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD34P28906 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD34P28906 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD34P28906 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD34P28906 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD34P28906 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD34P28906 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD34P28906 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD34P28906 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD34P28906 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD34P28906 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD34P28906 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD34P28906 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD34P28906 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD34P28906 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD34P28906 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD34P28906 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD34P28906 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD34P28906 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD34P28906 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD34P28906 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD34P28906 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD34P28906 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD34P28906 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD34P28906 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD34P28906 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD34P28906 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
CD34P28906 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CD34P28906 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CD34P28906 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CD34P28906 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CD34P28906 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CD34P28906 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CD34P28906 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CD34P28906 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CD34P28906 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD34P28906 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD34P28906 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD34P28906 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD34P28906 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD34P28906 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD34P28906 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD34P28906 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CD34P28906 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD34P28906 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD34P28906 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD34P28906 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD34P28906 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD34P28906 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD34P28906 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD34P28906 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD34P28906 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CD34P28906 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD34P28906 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD34P28906 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD34P28906 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD34P28906 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD34P28906 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD34P28906 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD34P28906 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD34P28906 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD34P28906 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD34P28906 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD34P28906 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD34P28906 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD34P28906 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD34P28906 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD34P28906 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD34P28906 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD34P28906 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD34P28906 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD34P28906 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD34P28906 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD34P28906 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD34P28906 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD34P28906 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD34P28906 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD34P28906 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD34P28906 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms