Protein–RNA interactions for Protein: Q86XE0

SNX32, Sorting nexin-32, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX32Q86XE0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX32Q86XE0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms