Protein–RNA interactions for Protein: P55145

MANF, Mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MANFP55145 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MANFP55145 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MANFP55145 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MANFP55145 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MANFP55145 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MANFP55145 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MANFP55145 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MANFP55145 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MANFP55145 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MANFP55145 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MANFP55145 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MANFP55145 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MANFP55145 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MANFP55145 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MANFP55145 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MANFP55145 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MANFP55145 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MANFP55145 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MANFP55145 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MANFP55145 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MANFP55145 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MANFP55145 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MANFP55145 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MANFP55145 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MANFP55145 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MANFP55145 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MANFP55145 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MANFP55145 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MANFP55145 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MANFP55145 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MANFP55145 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MANFP55145 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MANFP55145 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MANFP55145 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MANFP55145 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MANFP55145 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MANFP55145 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MANFP55145 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MANFP55145 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MANFP55145 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MANFP55145 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MANFP55145 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MANFP55145 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MANFP55145 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MANFP55145 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MANFP55145 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MANFP55145 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MANFP55145 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MANFP55145 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MANFP55145 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MANFP55145 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MANFP55145 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MANFP55145 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MANFP55145 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MANFP55145 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MANFP55145 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MANFP55145 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MANFP55145 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MANFP55145 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
MANFP55145 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MANFP55145 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MANFP55145 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MANFP55145 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MANFP55145 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MANFP55145 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MANFP55145 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MANFP55145 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MANFP55145 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MANFP55145 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MANFP55145 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MANFP55145 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MANFP55145 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MANFP55145 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MANFP55145 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MANFP55145 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MANFP55145 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MANFP55145 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MANFP55145 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MANFP55145 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MANFP55145 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MANFP55145 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MANFP55145 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MANFP55145 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MANFP55145 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MANFP55145 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MANFP55145 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MANFP55145 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MANFP55145 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MANFP55145 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MANFP55145 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
MANFP55145 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MANFP55145 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MANFP55145 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MANFP55145 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MANFP55145 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MANFP55145 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MANFP55145 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MANFP55145 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MANFP55145 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MANFP55145 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms