Protein–RNA interactions for Protein: P01375

TNF, Tumor necrosis factor, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFP01375 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFP01375 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFP01375 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFP01375 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFP01375 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFP01375 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFP01375 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFP01375 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFP01375 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFP01375 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFP01375 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFP01375 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFP01375 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFP01375 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFP01375 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFP01375 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFP01375 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFP01375 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFP01375 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFP01375 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFP01375 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFP01375 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFP01375 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFP01375 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFP01375 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFP01375 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFP01375 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFP01375 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFP01375 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFP01375 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFP01375 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFP01375 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFP01375 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFP01375 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFP01375 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFP01375 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFP01375 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFP01375 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFP01375 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFP01375 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFP01375 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFP01375 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFP01375 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFP01375 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFP01375 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFP01375 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFP01375 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFP01375 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFP01375 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFP01375 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFP01375 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFP01375 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFP01375 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFP01375 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFP01375 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFP01375 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFP01375 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFP01375 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFP01375 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFP01375 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFP01375 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFP01375 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFP01375 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFP01375 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFP01375 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFP01375 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFP01375 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFP01375 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFP01375 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFP01375 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFP01375 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFP01375 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFP01375 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFP01375 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFP01375 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFP01375 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFP01375 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFP01375 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFP01375 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFP01375 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFP01375 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFP01375 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFP01375 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFP01375 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFP01375 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFP01375 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFP01375 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFP01375 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFP01375 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFP01375 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFP01375 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFP01375 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFP01375 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFP01375 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFP01375 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFP01375 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFP01375 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFP01375 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFP01375 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFP01375 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms