Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 ARL6IP4-213ENST00000536073 562 ntTSL 218.35■□□□□ 0.536e-6■■□□□ 11.6
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PRPF4O43172 VPS53-215ENST00000573028 3204 ntTSL 217.98■□□□□ 0.471e-8■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.466e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 GPI-206ENST00000587384 810 ntTSL 317.86■□□□□ 0.456e-6■■□□□ 11.6
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PRPF4O43172 ZNF202-209ENST00000533463 855 ntTSL 317.39■□□□□ 0.376e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 GPI-216ENST00000592144 678 ntTSL 317.27■□□□□ 0.366e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 MTA1-214ENST00000494026 852 ntTSL 517.18■□□□□ 0.346e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 THOP1-211ENST00000590970 1104 ntTSL 317.02■□□□□ 0.321e-8■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.36e-6■■□□□ 11.6
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PRPF4O43172 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.296e-6■■□□□ 11.6
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PRPF4O43172 CDIP1-212ENST00000588381 484 ntTSL 316.76■□□□□ 0.276e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.266e-6■■□□□ 11.6
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PRPF4O43172 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.246e-6■■□□□ 11.6
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PRPF4O43172 GPI-209ENST00000589399 565 ntTSL 516.4■□□□□ 0.226e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 GPI-217ENST00000592277 615 ntTSL 416.4■□□□□ 0.226e-6■■□□□ 11.6
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PRPF4O43172 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.176e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 TMUB2-206ENST00000587326 1839 ntTSL 1 (best)16.05■□□□□ 0.166e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 RPTOR-209ENST00000575542 5536 ntTSL 1 (best)16.03■□□□□ 0.166e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 RECQL4-208ENST00000534626 1165 ntTSL 516■□□□□ 0.156e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 MTA1-216ENST00000498644 871 ntTSL 215.99■□□□□ 0.156e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.146e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 ZNF202-202ENST00000525391 640 ntTSL 215.9■□□□□ 0.146e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.136e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 MTA1-210ENST00000481012 987 ntTSL 515.82■□□□□ 0.123e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 SAP30BP-217ENST00000582022 2409 ntTSL 1 (best)15.81■□□□□ 0.125e-11■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.111e-8■■□□□ 11.6
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PRPF4O43172 ZNF202-208ENST00000530944 585 ntTSL 515.29■□□□□ 0.046e-6■■□□□ 11.6
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PRPF4O43172 VPS53-218ENST00000575207 575 ntTSL 415.19■□□□□ 0.021e-8■■□□□ 11.6
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PRPF4O43172 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -06e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.016e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.016e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 PIDD1-204ENST00000525028 3175 ntTSL 1 (best)14.67□□□□□ -0.066e-6■■□□□ 11.6
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PRPF4O43172 MTA1-204ENST00000424723 904 ntTSL 1 (best)14.54□□□□□ -0.083e-6■■□□□ 11.6
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PRPF4O43172 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.096e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.16e-6■■□□□ 11.6
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PRPF4O43172 CDIP1-203ENST00000562579 577 ntTSL 513.68□□□□□ -0.226e-6■■□□□ 11.6
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PRPF4O43172 SLC4A2-212ENST00000482950 500 ntTSL 413.35□□□□□ -0.276e-6■■□□□ 11.6
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PRPF4O43172 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.286e-6■■□□□ 11.6
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PRPF4O43172 CCHCR1-227ENST00000508852 589 ntTSL 413.04□□□□□ -0.321e-8■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 RTEL1-207ENST00000463361 575 ntTSL 413.01□□□□□ -0.331e-8■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 ZNF202-201ENST00000336139 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.336e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 TMUB2-214ENST00000590235 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.346e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 SAP30BP-220ENST00000583329 998 ntTSL 312.81□□□□□ -0.365e-11■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 DOT1L-206ENST00000482433 3658 ntTSL 212.79□□□□□ -0.366e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 CAPN1-227ENST00000533909 573 ntTSL 412.78□□□□□ -0.366e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 CCHCR1-205ENST00000428174 470 ntTSL 312.34□□□□□ -0.431e-8■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 SAP30BP-207ENST00000578756 652 ntTSL 212.25□□□□□ -0.455e-11■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 INTS1-206ENST00000493446 675 ntTSL 312.18□□□□□ -0.466e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 TMUB2-207ENST00000587630 1191 ntTSL 312.14□□□□□ -0.476e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 CDIP1-211ENST00000586768 548 ntTSL 411.56□□□□□ -0.566e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 XPO7-202ENST00000433566 4519 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.566e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 MTA1-219ENST00000551236 461 ntTSL 311.51□□□□□ -0.573e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 CLUHP3-207ENST00000563678 1303 ntBASIC11.04□□□□□ -0.646e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 FBXO38-206ENST00000503613 627 ntTSL 311.01□□□□□ -0.651e-8■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 GPI-207ENST00000587521 557 ntTSL 510.99□□□□□ -0.656e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 D2HGDH-216ENST00000496252 496 ntTSL 410.95□□□□□ -0.666e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 CCHCR1-219ENST00000505392 547 ntTSL 410.95□□□□□ -0.661e-8■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 SOX5-215ENST00000545921 2589 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.726e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 CAPN1-221ENST00000531068 496 ntTSL 410.53□□□□□ -0.726e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 CCHCR1-213ENST00000480060 601 ntTSL 310.41□□□□□ -0.741e-8■■□□□ 11.6
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