RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536073.1

ARL6IP4-213, Transcript of ADP ribosylation factor like GTPase 6 interacting protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene ARL6IP4, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL6IP4-213ENST00000536073 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.23■■■■■ 5.31
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ARL6IP4-213ENST00000536073 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.96■■■■■ 4.15
ARL6IP4-213ENST00000536073 NACADO15069 1562 aa40.74■■■■■ 4.11
ARL6IP4-213ENST00000536073 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.59■■■■■ 4.09
ARL6IP4-213ENST00000536073 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.23■■■■■ 4.03
ARL6IP4-213ENST00000536073 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.12■■■■■ 4.01
ARL6IP4-213ENST00000536073 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.1■■■■■ 4.01
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ARL6IP4-213ENST00000536073 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.82■■■■□ 3.97
ARL6IP4-213ENST00000536073 SCRIBQ14160 1630 aa39.41■■■■□ 3.9
ARL6IP4-213ENST00000536073 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.21■■■■□ 3.87
ARL6IP4-213ENST00000536073 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.83■■■■□ 3.81
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ARL6IP4-213ENST00000536073 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.66■■■■□ 3.78
ARL6IP4-213ENST00000536073 NCAPD3P42695 1498 aa37.6■■■■□ 3.61
ARL6IP4-213ENST00000536073 SMARCA4P51532 1647 aa37.6■■■■□ 3.61
ARL6IP4-213ENST00000536073 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.55■■■■□ 3.6
ARL6IP4-213ENST00000536073 SMARCA2P51531 1590 aa37.44■■■■□ 3.58
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ARL6IP4-213ENST00000536073 HMGXB3Q12766 1538 aa37.36■■■■□ 3.57
ARL6IP4-213ENST00000536073 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.21■■■■□ 3.55
ARL6IP4-213ENST00000536073 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.21■■■■□ 3.55
ARL6IP4-213ENST00000536073 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.2■■■■□ 3.55
ARL6IP4-213ENST00000536073 ERCC6Q03468 1493 aa37.05■■■■□ 3.52
ARL6IP4-213ENST00000536073 NESP48681 1621 aa37.01■■■■□ 3.52
ARL6IP4-213ENST00000536073 CUX2O14529 1486 aa36.88■■■■□ 3.5
ARL6IP4-213ENST00000536073 WIZO95785 1651 aa36.78■■■■□ 3.48
ARL6IP4-213ENST00000536073 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.73■■■■□ 3.47
ARL6IP4-213ENST00000536073 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.58■■■■□ 3.45
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ARL6IP4-213ENST00000536073 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.55■■■■□ 3.44
ARL6IP4-213ENST00000536073 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.5■■■■□ 3.43
ARL6IP4-213ENST00000536073 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.48■■■■□ 3.43
ARL6IP4-213ENST00000536073 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.47■■■■□ 3.43
ARL6IP4-213ENST00000536073 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.31■■■■□ 3.4
ARL6IP4-213ENST00000536073 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.19■■■■□ 3.38
ARL6IP4-213ENST00000536073 CFTRP13569 1480 aa36.12■■■■□ 3.37
ARL6IP4-213ENST00000536073 WDR62O43379 1518 aa36.12■■■■□ 3.37
ARL6IP4-213ENST00000536073 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.1■■■■□ 3.37
ARL6IP4-213ENST00000536073 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.08■■■■□ 3.37
ARL6IP4-213ENST00000536073 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.89■■■■□ 3.34
ARL6IP4-213ENST00000536073 PRDM2Q13029 1718 aa35.82■■■■□ 3.32
ARL6IP4-213ENST00000536073 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.8■■■■□ 3.32
ARL6IP4-213ENST00000536073 TOPBP1Q92547 1522 aa35.44■■■■□ 3.26
ARL6IP4-213ENST00000536073 IFT140Q96RY7 1462 aa35.35■■■■□ 3.25
ARL6IP4-213ENST00000536073 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.33■■■■□ 3.25
ARL6IP4-213ENST00000536073 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.25
ARL6IP4-213ENST00000536073 ABCC8Q09428 1581 aa35.3■■■■□ 3.24
ARL6IP4-213ENST00000536073 OSCARQ8IYS5 282 aa35.21■■■■□ 3.23
ARL6IP4-213ENST00000536073 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.15■■■■□ 3.22
ARL6IP4-213ENST00000536073 TRIM41Q8WV44 630 aa35.13■■■■□ 3.21
ARL6IP4-213ENST00000536073 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.12■■■■□ 3.21
ARL6IP4-213ENST00000536073 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.1■■■■□ 3.21
ARL6IP4-213ENST00000536073 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.2
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ARL6IP4-213ENST00000536073 CUX1P39880 1505 aa34.94■■■■□ 3.18
ARL6IP4-213ENST00000536073 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.92■■■■□ 3.18
ARL6IP4-213ENST00000536073 SOGA1O94964 1423 aa34.91■■■■□ 3.18
ARL6IP4-213ENST00000536073 CHD1O14646 1710 aa34.85■■■■□ 3.17
ARL6IP4-213ENST00000536073 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
ARL6IP4-213ENST00000536073 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.81■■■■□ 3.16
ARL6IP4-213ENST00000536073 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.81■■■■□ 3.16
ARL6IP4-213ENST00000536073 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.81■■■■□ 3.16
ARL6IP4-213ENST00000536073 WDR97A6NE52 1622 aa34.72■■■■□ 3.15
ARL6IP4-213ENST00000536073 ARHGEF11O15085 1522 aa34.71■■■■□ 3.15
ARL6IP4-213ENST00000536073 FBLN2P98095 1184 aa34.7■■■■□ 3.15
ARL6IP4-213ENST00000536073 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.68■■■■□ 3.14
ARL6IP4-213ENST00000536073 GRIN2BQ13224 1484 aa34.58■■■■□ 3.13
ARL6IP4-213ENST00000536073 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
ARL6IP4-213ENST00000536073 PBRM1Q86U86 1689 aa34.52■■■■□ 3.12
ARL6IP4-213ENST00000536073 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.51■■■■□ 3.12
ARL6IP4-213ENST00000536073 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.51■■■■□ 3.11
ARL6IP4-213ENST00000536073 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.48■■■■□ 3.11
ARL6IP4-213ENST00000536073 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
ARL6IP4-213ENST00000536073 SYNJ2O15056 1496 aa34.45■■■■□ 3.1
ARL6IP4-213ENST00000536073 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.44■■■■□ 3.1
ARL6IP4-213ENST00000536073 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.44■■■■□ 3.1
ARL6IP4-213ENST00000536073 SYNJ1O43426 1573 aa34.43■■■■□ 3.1
ARL6IP4-213ENST00000536073 TOP2BQ02880 1626 aa34.42■■■■□ 3.1
ARL6IP4-213ENST00000536073 ARAP1Q96P48 1450 aa34.41■■■■□ 3.1
ARL6IP4-213ENST00000536073 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.41■■■■□ 3.1
ARL6IP4-213ENST00000536073 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.41■■■■□ 3.1
ARL6IP4-213ENST00000536073 ADAMTS12P58397 1594 aa34.2■■■■□ 3.07
ARL6IP4-213ENST00000536073 GRIN2AQ12879 1464 aa34.16■■■■□ 3.06
ARL6IP4-213ENST00000536073 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.08■■■■□ 3.05
ARL6IP4-213ENST00000536073 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.06■■■■□ 3.04
ARL6IP4-213ENST00000536073 CEP170Q5SW79 1584 aa34.06■■■■□ 3.04
ARL6IP4-213ENST00000536073 NUP160Q12769 1436 aa34.04■■■■□ 3.04
ARL6IP4-213ENST00000536073 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.96■■■■□ 3.03
ARL6IP4-213ENST00000536073 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.94■■■■□ 3.02
ARL6IP4-213ENST00000536073 SHROOM2Q13796 1616 aa33.87■■■■□ 3.01
ARL6IP4-213ENST00000536073 KIF27Q86VH2 1401 aa33.72■■■□□ 2.99
ARL6IP4-213ENST00000536073 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.72■■■□□ 2.99
ARL6IP4-213ENST00000536073 IGF1RP08069 1367 aa33.7■■■□□ 2.98
ARL6IP4-213ENST00000536073 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.68■■■□□ 2.98
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