Protein–RNA interactions for Protein: P21291

CSRP1, Cysteine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP1P21291 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CSRP1P21291 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CSRP1P21291 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSRP1P21291 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSRP1P21291 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSRP1P21291 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP1P21291 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP1P21291 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP1P21291 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP1P21291 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP1P21291 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP1P21291 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP1P21291 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP1P21291 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP1P21291 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP1P21291 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP1P21291 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP1P21291 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP1P21291 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP1P21291 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP1P21291 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP1P21291 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP1P21291 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP1P21291 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP1P21291 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP1P21291 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP1P21291 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP1P21291 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP1P21291 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP1P21291 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP1P21291 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP1P21291 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP1P21291 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP1P21291 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP1P21291 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP1P21291 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms