Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP9P55211 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP9P55211 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP9P55211 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP9P55211 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP9P55211 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP9P55211 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP9P55211 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP9P55211 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP9P55211 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP9P55211 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP9P55211 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP9P55211 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP9P55211 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP9P55211 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP9P55211 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP9P55211 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP9P55211 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP9P55211 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP9P55211 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP9P55211 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP9P55211 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP9P55211 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP9P55211 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP9P55211 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP9P55211 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP9P55211 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP9P55211 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP9P55211 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP9P55211 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP9P55211 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP9P55211 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP9P55211 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP9P55211 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP9P55211 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP9P55211 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP9P55211 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP9P55211 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP9P55211 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP9P55211 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP9P55211 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP9P55211 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP9P55211 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms