RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366221.3

AL645728.1-201, humanhuman

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Gene AL645728.1, Length 2,101 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AL645728.1-201ENST00000366221 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.03■■■■□ 3.68
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AL645728.1-201ENST00000366221 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.96■■■□□ 2.71
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AL645728.1-201ENST00000366221 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.24■■■□□ 2.59
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AL645728.1-201ENST00000366221 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.44■■■□□ 2.46
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AL645728.1-201ENST00000366221 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
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AL645728.1-201ENST00000366221 SMARCA4P51532 1647 aa29.18■■■□□ 2.26
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AL645728.1-201ENST00000366221 SMARCA2P51531 1590 aa28.63■■■□□ 2.17
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AL645728.1-201ENST00000366221 TRIM41Q8WV44 630 aa28.28■■■□□ 2.12
AL645728.1-201ENST00000366221 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.23■■■□□ 2.11
AL645728.1-201ENST00000366221 ABCC8Q09428 1581 aa28.05■■■□□ 2.08
AL645728.1-201ENST00000366221 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.88■■■□□ 2.05
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AL645728.1-201ENST00000366221 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.83■■■□□ 2.05
AL645728.1-201ENST00000366221 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
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AL645728.1-201ENST00000366221 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.68■■□□□ 1.86
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AL645728.1-201ENST00000366221 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.63■■□□□ 1.85
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AL645728.1-201ENST00000366221 IFT140Q96RY7 1462 aa26.53■■□□□ 1.84
AL645728.1-201ENST00000366221 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.53■■□□□ 1.84
AL645728.1-201ENST00000366221 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
AL645728.1-201ENST00000366221 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.46■■□□□ 1.83
AL645728.1-201ENST00000366221 ARAP1Q96P48 1450 aa26.42■■□□□ 1.82
AL645728.1-201ENST00000366221 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.41■■□□□ 1.82
AL645728.1-201ENST00000366221 PBRM1Q86U86 1689 aa26.39■■□□□ 1.82
AL645728.1-201ENST00000366221 GRIN2BQ13224 1484 aa26.38■■□□□ 1.81
AL645728.1-201ENST00000366221 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.33■■□□□ 1.81
AL645728.1-201ENST00000366221 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
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